Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CRAMP1Q96RY5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CRAMP1Q96RY5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CRAMP1Q96RY5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CRAMP1Q96RY5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CRAMP1Q96RY5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CRAMP1Q96RY5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CRAMP1Q96RY5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CRAMP1Q96RY5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CRAMP1Q96RY5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CRAMP1Q96RY5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CRAMP1Q96RY5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CRAMP1Q96RY5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CRAMP1Q96RY5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CRAMP1Q96RY5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CRAMP1Q96RY5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CRAMP1Q96RY5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CRAMP1Q96RY5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CRAMP1Q96RY5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CRAMP1Q96RY5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
CRAMP1Q96RY5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CRAMP1Q96RY5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CRAMP1Q96RY5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CRAMP1Q96RY5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CRAMP1Q96RY5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CRAMP1Q96RY5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CRAMP1Q96RY5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CRAMP1Q96RY5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CRAMP1Q96RY5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CRAMP1Q96RY5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CRAMP1Q96RY5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CRAMP1Q96RY5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CRAMP1Q96RY5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
CRAMP1Q96RY5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
CRAMP1Q96RY5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CRAMP1Q96RY5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CRAMP1Q96RY5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CRAMP1Q96RY5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CRAMP1Q96RY5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CRAMP1Q96RY5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CRAMP1Q96RY5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CRAMP1Q96RY5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CRAMP1Q96RY5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CRAMP1Q96RY5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CRAMP1Q96RY5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CRAMP1Q96RY5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CRAMP1Q96RY5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CRAMP1Q96RY5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CRAMP1Q96RY5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CRAMP1Q96RY5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CRAMP1Q96RY5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CRAMP1Q96RY5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CRAMP1Q96RY5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CRAMP1Q96RY5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CRAMP1Q96RY5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CRAMP1Q96RY5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CRAMP1Q96RY5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CRAMP1Q96RY5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CRAMP1Q96RY5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CRAMP1Q96RY5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CRAMP1Q96RY5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CRAMP1Q96RY5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CRAMP1Q96RY5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CRAMP1Q96RY5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CRAMP1Q96RY5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CRAMP1Q96RY5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CRAMP1Q96RY5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CRAMP1Q96RY5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CRAMP1Q96RY5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CRAMP1Q96RY5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CRAMP1Q96RY5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CRAMP1Q96RY5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CRAMP1Q96RY5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CRAMP1Q96RY5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CRAMP1Q96RY5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CRAMP1Q96RY5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CRAMP1Q96RY5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CRAMP1Q96RY5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CRAMP1Q96RY5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CRAMP1Q96RY5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CRAMP1Q96RY5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CRAMP1Q96RY5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CRAMP1Q96RY5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CRAMP1Q96RY5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CRAMP1Q96RY5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CRAMP1Q96RY5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CRAMP1Q96RY5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CRAMP1Q96RY5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CRAMP1Q96RY5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CRAMP1Q96RY5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CRAMP1Q96RY5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CRAMP1Q96RY5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CRAMP1Q96RY5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CRAMP1Q96RY5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CRAMP1Q96RY5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CRAMP1Q96RY5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CRAMP1Q96RY5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CRAMP1Q96RY5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CRAMP1Q96RY5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms