Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PANX3Q96QZ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PANX3Q96QZ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PANX3Q96QZ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PANX3Q96QZ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PANX3Q96QZ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PANX3Q96QZ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PANX3Q96QZ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PANX3Q96QZ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PANX3Q96QZ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PANX3Q96QZ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PANX3Q96QZ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PANX3Q96QZ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PANX3Q96QZ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PANX3Q96QZ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PANX3Q96QZ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PANX3Q96QZ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PANX3Q96QZ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PANX3Q96QZ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PANX3Q96QZ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PANX3Q96QZ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PANX3Q96QZ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PANX3Q96QZ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PANX3Q96QZ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PANX3Q96QZ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PANX3Q96QZ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PANX3Q96QZ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PANX3Q96QZ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PANX3Q96QZ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PANX3Q96QZ0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PANX3Q96QZ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PANX3Q96QZ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PANX3Q96QZ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PANX3Q96QZ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PANX3Q96QZ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PANX3Q96QZ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PANX3Q96QZ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PANX3Q96QZ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PANX3Q96QZ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PANX3Q96QZ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PANX3Q96QZ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PANX3Q96QZ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PANX3Q96QZ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PANX3Q96QZ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PANX3Q96QZ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PANX3Q96QZ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PANX3Q96QZ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PANX3Q96QZ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PANX3Q96QZ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PANX3Q96QZ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PANX3Q96QZ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PANX3Q96QZ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PANX3Q96QZ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PANX3Q96QZ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PANX3Q96QZ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PANX3Q96QZ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PANX3Q96QZ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PANX3Q96QZ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PANX3Q96QZ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PANX3Q96QZ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PANX3Q96QZ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PANX3Q96QZ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PANX3Q96QZ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PANX3Q96QZ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PANX3Q96QZ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PANX3Q96QZ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PANX3Q96QZ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PANX3Q96QZ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PANX3Q96QZ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PANX3Q96QZ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PANX3Q96QZ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PANX3Q96QZ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PANX3Q96QZ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PANX3Q96QZ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PANX3Q96QZ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PANX3Q96QZ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PANX3Q96QZ0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PANX3Q96QZ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PANX3Q96QZ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PANX3Q96QZ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PANX3Q96QZ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PANX3Q96QZ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PANX3Q96QZ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PANX3Q96QZ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PANX3Q96QZ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PANX3Q96QZ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PANX3Q96QZ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PANX3Q96QZ0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PANX3Q96QZ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PANX3Q96QZ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PANX3Q96QZ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PANX3Q96QZ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PANX3Q96QZ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PANX3Q96QZ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PANX3Q96QZ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PANX3Q96QZ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PANX3Q96QZ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PANX3Q96QZ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PANX3Q96QZ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PANX3Q96QZ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms