Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MCEEQ96PE7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MCEEQ96PE7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
MCEEQ96PE7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MCEEQ96PE7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MCEEQ96PE7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MCEEQ96PE7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MCEEQ96PE7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MCEEQ96PE7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MCEEQ96PE7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MCEEQ96PE7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MCEEQ96PE7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MCEEQ96PE7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MCEEQ96PE7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MCEEQ96PE7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MCEEQ96PE7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MCEEQ96PE7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MCEEQ96PE7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MCEEQ96PE7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MCEEQ96PE7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MCEEQ96PE7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MCEEQ96PE7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MCEEQ96PE7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MCEEQ96PE7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MCEEQ96PE7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MCEEQ96PE7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MCEEQ96PE7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MCEEQ96PE7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCEEQ96PE7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCEEQ96PE7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MCEEQ96PE7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MCEEQ96PE7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MCEEQ96PE7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCEEQ96PE7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCEEQ96PE7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MCEEQ96PE7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MCEEQ96PE7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCEEQ96PE7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCEEQ96PE7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MCEEQ96PE7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MCEEQ96PE7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MCEEQ96PE7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCEEQ96PE7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MCEEQ96PE7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MCEEQ96PE7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MCEEQ96PE7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCEEQ96PE7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCEEQ96PE7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MCEEQ96PE7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MCEEQ96PE7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCEEQ96PE7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCEEQ96PE7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MCEEQ96PE7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MCEEQ96PE7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MCEEQ96PE7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MCEEQ96PE7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MCEEQ96PE7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MCEEQ96PE7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MCEEQ96PE7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MCEEQ96PE7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MCEEQ96PE7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MCEEQ96PE7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MCEEQ96PE7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MCEEQ96PE7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MCEEQ96PE7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MCEEQ96PE7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MCEEQ96PE7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MCEEQ96PE7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MCEEQ96PE7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MCEEQ96PE7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
MCEEQ96PE7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MCEEQ96PE7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MCEEQ96PE7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MCEEQ96PE7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MCEEQ96PE7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MCEEQ96PE7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MCEEQ96PE7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MCEEQ96PE7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MCEEQ96PE7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MCEEQ96PE7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MCEEQ96PE7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MCEEQ96PE7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MCEEQ96PE7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MCEEQ96PE7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCEEQ96PE7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCEEQ96PE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MCEEQ96PE7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MCEEQ96PE7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MCEEQ96PE7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCEEQ96PE7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MCEEQ96PE7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MCEEQ96PE7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCEEQ96PE7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MCEEQ96PE7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCEEQ96PE7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCEEQ96PE7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCEEQ96PE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MCEEQ96PE7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCEEQ96PE7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MCEEQ96PE7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms