Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX22Q96L94 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX22Q96L94 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX22Q96L94 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX22Q96L94 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX22Q96L94 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX22Q96L94 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX22Q96L94 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX22Q96L94 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX22Q96L94 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX22Q96L94 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX22Q96L94 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX22Q96L94 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX22Q96L94 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX22Q96L94 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX22Q96L94 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX22Q96L94 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX22Q96L94 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX22Q96L94 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX22Q96L94 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX22Q96L94 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX22Q96L94 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX22Q96L94 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX22Q96L94 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX22Q96L94 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX22Q96L94 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX22Q96L94 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX22Q96L94 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX22Q96L94 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX22Q96L94 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX22Q96L94 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX22Q96L94 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX22Q96L94 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX22Q96L94 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX22Q96L94 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX22Q96L94 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX22Q96L94 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX22Q96L94 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX22Q96L94 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX22Q96L94 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX22Q96L94 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX22Q96L94 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX22Q96L94 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX22Q96L94 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX22Q96L94 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX22Q96L94 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX22Q96L94 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX22Q96L94 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX22Q96L94 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX22Q96L94 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX22Q96L94 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX22Q96L94 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX22Q96L94 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX22Q96L94 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX22Q96L94 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX22Q96L94 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX22Q96L94 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX22Q96L94 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX22Q96L94 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX22Q96L94 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX22Q96L94 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX22Q96L94 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX22Q96L94 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX22Q96L94 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX22Q96L94 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX22Q96L94 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX22Q96L94 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX22Q96L94 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX22Q96L94 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX22Q96L94 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX22Q96L94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX22Q96L94 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX22Q96L94 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX22Q96L94 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX22Q96L94 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX22Q96L94 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX22Q96L94 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX22Q96L94 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX22Q96L94 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX22Q96L94 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX22Q96L94 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX22Q96L94 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX22Q96L94 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX22Q96L94 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX22Q96L94 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX22Q96L94 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX22Q96L94 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX22Q96L94 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX22Q96L94 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX22Q96L94 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX22Q96L94 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX22Q96L94 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX22Q96L94 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX22Q96L94 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX22Q96L94 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX22Q96L94 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX22Q96L94 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX22Q96L94 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX22Q96L94 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX22Q96L94 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms