Protein–RNA interactions for Protein: Q96L03

SPATA17, Spermatogenesis-associated protein 17, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA17Q96L03 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SPATA17Q96L03 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SPATA17Q96L03 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SPATA17Q96L03 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPATA17Q96L03 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SPATA17Q96L03 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SPATA17Q96L03 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SPATA17Q96L03 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SPATA17Q96L03 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SPATA17Q96L03 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SPATA17Q96L03 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SPATA17Q96L03 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPATA17Q96L03 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SPATA17Q96L03 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SPATA17Q96L03 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPATA17Q96L03 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPATA17Q96L03 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPATA17Q96L03 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPATA17Q96L03 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPATA17Q96L03 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPATA17Q96L03 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPATA17Q96L03 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SPATA17Q96L03 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SPATA17Q96L03 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SPATA17Q96L03 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SPATA17Q96L03 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPATA17Q96L03 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPATA17Q96L03 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SPATA17Q96L03 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SPATA17Q96L03 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SPATA17Q96L03 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SPATA17Q96L03 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPATA17Q96L03 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPATA17Q96L03 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SPATA17Q96L03 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPATA17Q96L03 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPATA17Q96L03 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPATA17Q96L03 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SPATA17Q96L03 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPATA17Q96L03 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPATA17Q96L03 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPATA17Q96L03 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPATA17Q96L03 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SPATA17Q96L03 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SPATA17Q96L03 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPATA17Q96L03 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPATA17Q96L03 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SPATA17Q96L03 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPATA17Q96L03 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPATA17Q96L03 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
SPATA17Q96L03 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPATA17Q96L03 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SPATA17Q96L03 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPATA17Q96L03 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPATA17Q96L03 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPATA17Q96L03 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPATA17Q96L03 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPATA17Q96L03 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPATA17Q96L03 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SPATA17Q96L03 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SPATA17Q96L03 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPATA17Q96L03 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SPATA17Q96L03 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SPATA17Q96L03 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SPATA17Q96L03 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SPATA17Q96L03 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SPATA17Q96L03 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SPATA17Q96L03 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPATA17Q96L03 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SPATA17Q96L03 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SPATA17Q96L03 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SPATA17Q96L03 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SPATA17Q96L03 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SPATA17Q96L03 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SPATA17Q96L03 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SPATA17Q96L03 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SPATA17Q96L03 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SPATA17Q96L03 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SPATA17Q96L03 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SPATA17Q96L03 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SPATA17Q96L03 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SPATA17Q96L03 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SPATA17Q96L03 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SPATA17Q96L03 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SPATA17Q96L03 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SPATA17Q96L03 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPATA17Q96L03 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SPATA17Q96L03 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPATA17Q96L03 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SPATA17Q96L03 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SPATA17Q96L03 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SPATA17Q96L03 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SPATA17Q96L03 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SPATA17Q96L03 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPATA17Q96L03 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPATA17Q96L03 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SPATA17Q96L03 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SPATA17Q96L03 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SPATA17Q96L03 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SPATA17Q96L03 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
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