Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HPS3Q969F9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HPS3Q969F9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
HPS3Q969F9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
HPS3Q969F9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HPS3Q969F9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HPS3Q969F9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HPS3Q969F9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HPS3Q969F9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HPS3Q969F9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HPS3Q969F9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HPS3Q969F9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HPS3Q969F9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HPS3Q969F9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
HPS3Q969F9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HPS3Q969F9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HPS3Q969F9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HPS3Q969F9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HPS3Q969F9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HPS3Q969F9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HPS3Q969F9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HPS3Q969F9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HPS3Q969F9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HPS3Q969F9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HPS3Q969F9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
HPS3Q969F9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HPS3Q969F9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HPS3Q969F9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HPS3Q969F9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HPS3Q969F9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HPS3Q969F9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HPS3Q969F9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HPS3Q969F9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HPS3Q969F9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HPS3Q969F9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HPS3Q969F9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HPS3Q969F9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HPS3Q969F9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HPS3Q969F9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HPS3Q969F9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HPS3Q969F9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HPS3Q969F9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HPS3Q969F9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HPS3Q969F9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HPS3Q969F9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HPS3Q969F9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HPS3Q969F9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HPS3Q969F9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HPS3Q969F9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HPS3Q969F9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HPS3Q969F9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HPS3Q969F9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HPS3Q969F9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HPS3Q969F9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HPS3Q969F9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HPS3Q969F9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HPS3Q969F9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HPS3Q969F9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HPS3Q969F9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HPS3Q969F9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HPS3Q969F9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HPS3Q969F9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HPS3Q969F9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HPS3Q969F9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
HPS3Q969F9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HPS3Q969F9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HPS3Q969F9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HPS3Q969F9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HPS3Q969F9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HPS3Q969F9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HPS3Q969F9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HPS3Q969F9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HPS3Q969F9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HPS3Q969F9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HPS3Q969F9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HPS3Q969F9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HPS3Q969F9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HPS3Q969F9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HPS3Q969F9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HPS3Q969F9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HPS3Q969F9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HPS3Q969F9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HPS3Q969F9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HPS3Q969F9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HPS3Q969F9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HPS3Q969F9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HPS3Q969F9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HPS3Q969F9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HPS3Q969F9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HPS3Q969F9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HPS3Q969F9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HPS3Q969F9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
HPS3Q969F9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HPS3Q969F9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HPS3Q969F9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HPS3Q969F9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HPS3Q969F9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HPS3Q969F9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HPS3Q969F9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HPS3Q969F9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms