Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CUL5Q93034 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CUL5Q93034 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CUL5Q93034 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CUL5Q93034 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CUL5Q93034 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CUL5Q93034 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CUL5Q93034 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CUL5Q93034 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CUL5Q93034 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CUL5Q93034 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CUL5Q93034 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CUL5Q93034 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CUL5Q93034 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CUL5Q93034 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CUL5Q93034 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CUL5Q93034 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CUL5Q93034 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CUL5Q93034 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CUL5Q93034 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CUL5Q93034 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUL5Q93034 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CUL5Q93034 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CUL5Q93034 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CUL5Q93034 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CUL5Q93034 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CUL5Q93034 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CUL5Q93034 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CUL5Q93034 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CUL5Q93034 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CUL5Q93034 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CUL5Q93034 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CUL5Q93034 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CUL5Q93034 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CUL5Q93034 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CUL5Q93034 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CUL5Q93034 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CUL5Q93034 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CUL5Q93034 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CUL5Q93034 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CUL5Q93034 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CUL5Q93034 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CUL5Q93034 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CUL5Q93034 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CUL5Q93034 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CUL5Q93034 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CUL5Q93034 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CUL5Q93034 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CUL5Q93034 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CUL5Q93034 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CUL5Q93034 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CUL5Q93034 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CUL5Q93034 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CUL5Q93034 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CUL5Q93034 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CUL5Q93034 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CUL5Q93034 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CUL5Q93034 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CUL5Q93034 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CUL5Q93034 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CUL5Q93034 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CUL5Q93034 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CUL5Q93034 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CUL5Q93034 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CUL5Q93034 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUL5Q93034 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CUL5Q93034 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CUL5Q93034 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUL5Q93034 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CUL5Q93034 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CUL5Q93034 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CUL5Q93034 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CUL5Q93034 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUL5Q93034 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CUL5Q93034 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUL5Q93034 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUL5Q93034 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUL5Q93034 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUL5Q93034 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CUL5Q93034 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CUL5Q93034 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CUL5Q93034 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CUL5Q93034 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CUL5Q93034 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CUL5Q93034 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CUL5Q93034 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CUL5Q93034 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CUL5Q93034 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CUL5Q93034 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CUL5Q93034 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CUL5Q93034 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CUL5Q93034 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUL5Q93034 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUL5Q93034 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CUL5Q93034 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CUL5Q93034 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CUL5Q93034 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CUL5Q93034 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CUL5Q93034 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CUL5Q93034 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms