Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPL3LQ92901 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPL3LQ92901 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPL3LQ92901 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPL3LQ92901 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPL3LQ92901 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPL3LQ92901 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPL3LQ92901 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPL3LQ92901 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPL3LQ92901 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPL3LQ92901 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPL3LQ92901 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPL3LQ92901 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPL3LQ92901 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPL3LQ92901 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPL3LQ92901 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPL3LQ92901 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPL3LQ92901 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPL3LQ92901 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPL3LQ92901 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPL3LQ92901 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL3LQ92901 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL3LQ92901 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPL3LQ92901 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPL3LQ92901 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPL3LQ92901 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RPL3LQ92901 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPL3LQ92901 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL3LQ92901 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPL3LQ92901 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPL3LQ92901 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPL3LQ92901 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPL3LQ92901 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPL3LQ92901 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL3LQ92901 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPL3LQ92901 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPL3LQ92901 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPL3LQ92901 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPL3LQ92901 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPL3LQ92901 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL3LQ92901 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPL3LQ92901 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPL3LQ92901 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPL3LQ92901 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPL3LQ92901 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPL3LQ92901 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPL3LQ92901 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL3LQ92901 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL3LQ92901 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL3LQ92901 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL3LQ92901 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL3LQ92901 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL3LQ92901 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL3LQ92901 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL3LQ92901 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPL3LQ92901 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL3LQ92901 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL3LQ92901 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL3LQ92901 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL3LQ92901 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL3LQ92901 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL3LQ92901 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL3LQ92901 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL3LQ92901 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL3LQ92901 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL3LQ92901 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPL3LQ92901 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPL3LQ92901 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPL3LQ92901 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPL3LQ92901 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPL3LQ92901 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL3LQ92901 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPL3LQ92901 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL3LQ92901 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL3LQ92901 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPL3LQ92901 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL3LQ92901 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL3LQ92901 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPL3LQ92901 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPL3LQ92901 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPL3LQ92901 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL3LQ92901 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPL3LQ92901 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL3LQ92901 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL3LQ92901 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPL3LQ92901 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL3LQ92901 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPL3LQ92901 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL3LQ92901 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPL3LQ92901 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL3LQ92901 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPL3LQ92901 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms