Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RORBQ92753 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RORBQ92753 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RORBQ92753 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RORBQ92753 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RORBQ92753 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RORBQ92753 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RORBQ92753 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RORBQ92753 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RORBQ92753 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RORBQ92753 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RORBQ92753 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RORBQ92753 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RORBQ92753 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RORBQ92753 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RORBQ92753 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RORBQ92753 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RORBQ92753 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RORBQ92753 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RORBQ92753 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RORBQ92753 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RORBQ92753 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RORBQ92753 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RORBQ92753 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RORBQ92753 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RORBQ92753 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RORBQ92753 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RORBQ92753 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RORBQ92753 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RORBQ92753 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RORBQ92753 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RORBQ92753 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RORBQ92753 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RORBQ92753 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RORBQ92753 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RORBQ92753 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RORBQ92753 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RORBQ92753 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RORBQ92753 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RORBQ92753 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RORBQ92753 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RORBQ92753 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RORBQ92753 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RORBQ92753 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RORBQ92753 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RORBQ92753 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RORBQ92753 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RORBQ92753 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RORBQ92753 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RORBQ92753 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RORBQ92753 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RORBQ92753 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RORBQ92753 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RORBQ92753 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RORBQ92753 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RORBQ92753 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RORBQ92753 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RORBQ92753 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RORBQ92753 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RORBQ92753 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RORBQ92753 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RORBQ92753 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RORBQ92753 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RORBQ92753 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RORBQ92753 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RORBQ92753 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RORBQ92753 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RORBQ92753 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RORBQ92753 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RORBQ92753 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RORBQ92753 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RORBQ92753 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RORBQ92753 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RORBQ92753 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RORBQ92753 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RORBQ92753 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RORBQ92753 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RORBQ92753 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RORBQ92753 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RORBQ92753 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RORBQ92753 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RORBQ92753 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RORBQ92753 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RORBQ92753 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RORBQ92753 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RORBQ92753 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RORBQ92753 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RORBQ92753 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RORBQ92753 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RORBQ92753 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RORBQ92753 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RORBQ92753 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RORBQ92753 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RORBQ92753 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RORBQ92753 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RORBQ92753 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RORBQ92753 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RORBQ92753 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RORBQ92753 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RORBQ92753 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms