Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GNPDA2Q8TDQ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GNPDA2Q8TDQ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GNPDA2Q8TDQ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GNPDA2Q8TDQ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GNPDA2Q8TDQ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GNPDA2Q8TDQ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GNPDA2Q8TDQ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GNPDA2Q8TDQ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GNPDA2Q8TDQ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GNPDA2Q8TDQ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GNPDA2Q8TDQ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GNPDA2Q8TDQ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPDA2Q8TDQ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPDA2Q8TDQ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPDA2Q8TDQ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNPDA2Q8TDQ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNPDA2Q8TDQ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNPDA2Q8TDQ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNPDA2Q8TDQ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GNPDA2Q8TDQ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GNPDA2Q8TDQ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNPDA2Q8TDQ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNPDA2Q8TDQ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GNPDA2Q8TDQ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPDA2Q8TDQ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPDA2Q8TDQ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNPDA2Q8TDQ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNPDA2Q8TDQ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPDA2Q8TDQ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPDA2Q8TDQ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPDA2Q8TDQ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPDA2Q8TDQ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPDA2Q8TDQ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPDA2Q8TDQ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPDA2Q8TDQ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GNPDA2Q8TDQ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPDA2Q8TDQ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GNPDA2Q8TDQ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GNPDA2Q8TDQ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNPDA2Q8TDQ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GNPDA2Q8TDQ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNPDA2Q8TDQ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNPDA2Q8TDQ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPDA2Q8TDQ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPDA2Q8TDQ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPDA2Q8TDQ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPDA2Q8TDQ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPDA2Q8TDQ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPDA2Q8TDQ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPDA2Q8TDQ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPDA2Q8TDQ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNPDA2Q8TDQ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPDA2Q8TDQ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPDA2Q8TDQ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPDA2Q8TDQ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPDA2Q8TDQ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPDA2Q8TDQ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPDA2Q8TDQ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPDA2Q8TDQ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNPDA2Q8TDQ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GNPDA2Q8TDQ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GNPDA2Q8TDQ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GNPDA2Q8TDQ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPDA2Q8TDQ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPDA2Q8TDQ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GNPDA2Q8TDQ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPDA2Q8TDQ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPDA2Q8TDQ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPDA2Q8TDQ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPDA2Q8TDQ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPDA2Q8TDQ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPDA2Q8TDQ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPDA2Q8TDQ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPDA2Q8TDQ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPDA2Q8TDQ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GNPDA2Q8TDQ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPDA2Q8TDQ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPDA2Q8TDQ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPDA2Q8TDQ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPDA2Q8TDQ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GNPDA2Q8TDQ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPDA2Q8TDQ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPDA2Q8TDQ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPDA2Q8TDQ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPDA2Q8TDQ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPDA2Q8TDQ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPDA2Q8TDQ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPDA2Q8TDQ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms