Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT6

NPLOC4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4Q8TAT6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NPLOC4Q8TAT6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NPLOC4Q8TAT6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NPLOC4Q8TAT6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NPLOC4Q8TAT6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NPLOC4Q8TAT6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NPLOC4Q8TAT6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NPLOC4Q8TAT6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
NPLOC4Q8TAT6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NPLOC4Q8TAT6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NPLOC4Q8TAT6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NPLOC4Q8TAT6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NPLOC4Q8TAT6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NPLOC4Q8TAT6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NPLOC4Q8TAT6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPLOC4Q8TAT6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NPLOC4Q8TAT6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NPLOC4Q8TAT6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NPLOC4Q8TAT6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NPLOC4Q8TAT6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NPLOC4Q8TAT6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NPLOC4Q8TAT6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NPLOC4Q8TAT6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NPLOC4Q8TAT6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NPLOC4Q8TAT6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NPLOC4Q8TAT6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPLOC4Q8TAT6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPLOC4Q8TAT6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NPLOC4Q8TAT6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NPLOC4Q8TAT6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NPLOC4Q8TAT6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NPLOC4Q8TAT6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NPLOC4Q8TAT6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NPLOC4Q8TAT6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NPLOC4Q8TAT6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NPLOC4Q8TAT6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NPLOC4Q8TAT6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
NPLOC4Q8TAT6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NPLOC4Q8TAT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NPLOC4Q8TAT6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NPLOC4Q8TAT6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NPLOC4Q8TAT6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NPLOC4Q8TAT6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NPLOC4Q8TAT6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NPLOC4Q8TAT6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NPLOC4Q8TAT6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NPLOC4Q8TAT6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NPLOC4Q8TAT6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NPLOC4Q8TAT6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NPLOC4Q8TAT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NPLOC4Q8TAT6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NPLOC4Q8TAT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NPLOC4Q8TAT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NPLOC4Q8TAT6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NPLOC4Q8TAT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NPLOC4Q8TAT6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NPLOC4Q8TAT6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NPLOC4Q8TAT6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NPLOC4Q8TAT6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NPLOC4Q8TAT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NPLOC4Q8TAT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NPLOC4Q8TAT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NPLOC4Q8TAT6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPLOC4Q8TAT6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NPLOC4Q8TAT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPLOC4Q8TAT6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPLOC4Q8TAT6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPLOC4Q8TAT6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPLOC4Q8TAT6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NPLOC4Q8TAT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPLOC4Q8TAT6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPLOC4Q8TAT6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPLOC4Q8TAT6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NPLOC4Q8TAT6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPLOC4Q8TAT6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPLOC4Q8TAT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPLOC4Q8TAT6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NPLOC4Q8TAT6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NPLOC4Q8TAT6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NPLOC4Q8TAT6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPLOC4Q8TAT6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NPLOC4Q8TAT6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NPLOC4Q8TAT6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NPLOC4Q8TAT6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPLOC4Q8TAT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPLOC4Q8TAT6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPLOC4Q8TAT6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPLOC4Q8TAT6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPLOC4Q8TAT6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPLOC4Q8TAT6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPLOC4Q8TAT6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPLOC4Q8TAT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms