Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBM4

UBAC2, Ubiquitin-associated domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC2Q8NBM4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBAC2Q8NBM4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBAC2Q8NBM4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBAC2Q8NBM4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBAC2Q8NBM4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBAC2Q8NBM4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBAC2Q8NBM4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBAC2Q8NBM4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBAC2Q8NBM4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBAC2Q8NBM4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC2Q8NBM4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBAC2Q8NBM4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBAC2Q8NBM4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBAC2Q8NBM4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBAC2Q8NBM4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBAC2Q8NBM4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAC2Q8NBM4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBAC2Q8NBM4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBAC2Q8NBM4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAC2Q8NBM4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAC2Q8NBM4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBAC2Q8NBM4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBAC2Q8NBM4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBAC2Q8NBM4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBAC2Q8NBM4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBAC2Q8NBM4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBAC2Q8NBM4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBAC2Q8NBM4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBAC2Q8NBM4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBAC2Q8NBM4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBAC2Q8NBM4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBAC2Q8NBM4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAC2Q8NBM4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBAC2Q8NBM4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAC2Q8NBM4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAC2Q8NBM4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBAC2Q8NBM4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBAC2Q8NBM4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBAC2Q8NBM4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBAC2Q8NBM4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAC2Q8NBM4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAC2Q8NBM4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBAC2Q8NBM4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAC2Q8NBM4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAC2Q8NBM4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBAC2Q8NBM4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBAC2Q8NBM4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBAC2Q8NBM4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAC2Q8NBM4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAC2Q8NBM4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAC2Q8NBM4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAC2Q8NBM4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAC2Q8NBM4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAC2Q8NBM4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAC2Q8NBM4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAC2Q8NBM4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAC2Q8NBM4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAC2Q8NBM4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAC2Q8NBM4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAC2Q8NBM4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAC2Q8NBM4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAC2Q8NBM4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAC2Q8NBM4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBAC2Q8NBM4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBAC2Q8NBM4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAC2Q8NBM4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAC2Q8NBM4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBAC2Q8NBM4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBAC2Q8NBM4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBAC2Q8NBM4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAC2Q8NBM4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAC2Q8NBM4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAC2Q8NBM4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAC2Q8NBM4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBAC2Q8NBM4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBAC2Q8NBM4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBAC2Q8NBM4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBAC2Q8NBM4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBAC2Q8NBM4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBAC2Q8NBM4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBAC2Q8NBM4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBAC2Q8NBM4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBAC2Q8NBM4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBAC2Q8NBM4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBAC2Q8NBM4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBAC2Q8NBM4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAC2Q8NBM4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBAC2Q8NBM4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBAC2Q8NBM4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBAC2Q8NBM4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBAC2Q8NBM4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAC2Q8NBM4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAC2Q8NBM4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms