Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF2

FOXRED2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED2Q8IWF2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXRED2Q8IWF2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXRED2Q8IWF2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXRED2Q8IWF2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXRED2Q8IWF2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXRED2Q8IWF2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXRED2Q8IWF2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXRED2Q8IWF2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXRED2Q8IWF2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXRED2Q8IWF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXRED2Q8IWF2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXRED2Q8IWF2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXRED2Q8IWF2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXRED2Q8IWF2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXRED2Q8IWF2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXRED2Q8IWF2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXRED2Q8IWF2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXRED2Q8IWF2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXRED2Q8IWF2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXRED2Q8IWF2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXRED2Q8IWF2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXRED2Q8IWF2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXRED2Q8IWF2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXRED2Q8IWF2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXRED2Q8IWF2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXRED2Q8IWF2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXRED2Q8IWF2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXRED2Q8IWF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXRED2Q8IWF2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXRED2Q8IWF2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXRED2Q8IWF2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXRED2Q8IWF2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXRED2Q8IWF2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXRED2Q8IWF2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXRED2Q8IWF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXRED2Q8IWF2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXRED2Q8IWF2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXRED2Q8IWF2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXRED2Q8IWF2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXRED2Q8IWF2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXRED2Q8IWF2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXRED2Q8IWF2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXRED2Q8IWF2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXRED2Q8IWF2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXRED2Q8IWF2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXRED2Q8IWF2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXRED2Q8IWF2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXRED2Q8IWF2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXRED2Q8IWF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXRED2Q8IWF2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXRED2Q8IWF2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXRED2Q8IWF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXRED2Q8IWF2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXRED2Q8IWF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXRED2Q8IWF2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXRED2Q8IWF2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXRED2Q8IWF2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXRED2Q8IWF2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXRED2Q8IWF2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXRED2Q8IWF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXRED2Q8IWF2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXRED2Q8IWF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXRED2Q8IWF2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXRED2Q8IWF2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXRED2Q8IWF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXRED2Q8IWF2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXRED2Q8IWF2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXRED2Q8IWF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXRED2Q8IWF2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXRED2Q8IWF2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXRED2Q8IWF2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXRED2Q8IWF2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXRED2Q8IWF2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXRED2Q8IWF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXRED2Q8IWF2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXRED2Q8IWF2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXRED2Q8IWF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXRED2Q8IWF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXRED2Q8IWF2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXRED2Q8IWF2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXRED2Q8IWF2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXRED2Q8IWF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXRED2Q8IWF2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXRED2Q8IWF2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXRED2Q8IWF2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXRED2Q8IWF2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXRED2Q8IWF2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXRED2Q8IWF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXRED2Q8IWF2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXRED2Q8IWF2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXRED2Q8IWF2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXRED2Q8IWF2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXRED2Q8IWF2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms