Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y01

DTX1, E3 ubiquitin-protein ligase DTX1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX1Q86Y01 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DTX1Q86Y01 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DTX1Q86Y01 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DTX1Q86Y01 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DTX1Q86Y01 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DTX1Q86Y01 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DTX1Q86Y01 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DTX1Q86Y01 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
DTX1Q86Y01 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
DTX1Q86Y01 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DTX1Q86Y01 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DTX1Q86Y01 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTX1Q86Y01 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DTX1Q86Y01 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DTX1Q86Y01 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DTX1Q86Y01 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DTX1Q86Y01 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DTX1Q86Y01 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DTX1Q86Y01 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DTX1Q86Y01 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DTX1Q86Y01 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DTX1Q86Y01 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DTX1Q86Y01 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DTX1Q86Y01 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DTX1Q86Y01 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DTX1Q86Y01 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DTX1Q86Y01 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DTX1Q86Y01 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DTX1Q86Y01 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DTX1Q86Y01 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DTX1Q86Y01 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DTX1Q86Y01 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DTX1Q86Y01 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DTX1Q86Y01 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DTX1Q86Y01 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DTX1Q86Y01 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DTX1Q86Y01 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DTX1Q86Y01 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DTX1Q86Y01 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DTX1Q86Y01 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DTX1Q86Y01 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DTX1Q86Y01 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DTX1Q86Y01 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DTX1Q86Y01 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DTX1Q86Y01 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DTX1Q86Y01 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DTX1Q86Y01 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DTX1Q86Y01 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DTX1Q86Y01 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DTX1Q86Y01 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DTX1Q86Y01 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DTX1Q86Y01 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DTX1Q86Y01 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DTX1Q86Y01 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTX1Q86Y01 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DTX1Q86Y01 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DTX1Q86Y01 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DTX1Q86Y01 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DTX1Q86Y01 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DTX1Q86Y01 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DTX1Q86Y01 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DTX1Q86Y01 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DTX1Q86Y01 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DTX1Q86Y01 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DTX1Q86Y01 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DTX1Q86Y01 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTX1Q86Y01 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DTX1Q86Y01 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DTX1Q86Y01 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DTX1Q86Y01 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DTX1Q86Y01 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DTX1Q86Y01 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DTX1Q86Y01 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DTX1Q86Y01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DTX1Q86Y01 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DTX1Q86Y01 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DTX1Q86Y01 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DTX1Q86Y01 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DTX1Q86Y01 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DTX1Q86Y01 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DTX1Q86Y01 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DTX1Q86Y01 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DTX1Q86Y01 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DTX1Q86Y01 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DTX1Q86Y01 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DTX1Q86Y01 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DTX1Q86Y01 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DTX1Q86Y01 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DTX1Q86Y01 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DTX1Q86Y01 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DTX1Q86Y01 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DTX1Q86Y01 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DTX1Q86Y01 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms