Protein–RNA interactions for Protein: Q5XUX1

FBXW9, F-box/WD repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW9Q5XUX1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXW9Q5XUX1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FBXW9Q5XUX1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FBXW9Q5XUX1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FBXW9Q5XUX1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXW9Q5XUX1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FBXW9Q5XUX1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FBXW9Q5XUX1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXW9Q5XUX1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXW9Q5XUX1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXW9Q5XUX1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXW9Q5XUX1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXW9Q5XUX1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW9Q5XUX1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW9Q5XUX1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FBXW9Q5XUX1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW9Q5XUX1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FBXW9Q5XUX1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FBXW9Q5XUX1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXW9Q5XUX1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FBXW9Q5XUX1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXW9Q5XUX1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXW9Q5XUX1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXW9Q5XUX1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXW9Q5XUX1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXW9Q5XUX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXW9Q5XUX1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXW9Q5XUX1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXW9Q5XUX1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXW9Q5XUX1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXW9Q5XUX1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXW9Q5XUX1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXW9Q5XUX1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXW9Q5XUX1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXW9Q5XUX1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXW9Q5XUX1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXW9Q5XUX1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW9Q5XUX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXW9Q5XUX1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXW9Q5XUX1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXW9Q5XUX1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXW9Q5XUX1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXW9Q5XUX1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXW9Q5XUX1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXW9Q5XUX1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXW9Q5XUX1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXW9Q5XUX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXW9Q5XUX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXW9Q5XUX1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXW9Q5XUX1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXW9Q5XUX1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXW9Q5XUX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXW9Q5XUX1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXW9Q5XUX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXW9Q5XUX1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXW9Q5XUX1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW9Q5XUX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW9Q5XUX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW9Q5XUX1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXW9Q5XUX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW9Q5XUX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXW9Q5XUX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXW9Q5XUX1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW9Q5XUX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXW9Q5XUX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW9Q5XUX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXW9Q5XUX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXW9Q5XUX1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXW9Q5XUX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXW9Q5XUX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXW9Q5XUX1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXW9Q5XUX1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXW9Q5XUX1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXW9Q5XUX1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXW9Q5XUX1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXW9Q5XUX1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXW9Q5XUX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXW9Q5XUX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXW9Q5XUX1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXW9Q5XUX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXW9Q5XUX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXW9Q5XUX1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXW9Q5XUX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXW9Q5XUX1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXW9Q5XUX1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXW9Q5XUX1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXW9Q5XUX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXW9Q5XUX1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXW9Q5XUX1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXW9Q5XUX1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXW9Q5XUX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXW9Q5XUX1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXW9Q5XUX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXW9Q5XUX1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXW9Q5XUX1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXW9Q5XUX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXW9Q5XUX1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXW9Q5XUX1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXW9Q5XUX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXW9Q5XUX1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms