Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1A1-AS1Q5TC04 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ATP1A1-AS1Q5TC04 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP1A1-AS1Q5TC04 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP1A1-AS1Q5TC04 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP1A1-AS1Q5TC04 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP1A1-AS1Q5TC04 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP1A1-AS1Q5TC04 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP1A1-AS1Q5TC04 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP1A1-AS1Q5TC04 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP1A1-AS1Q5TC04 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP1A1-AS1Q5TC04 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP1A1-AS1Q5TC04 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP1A1-AS1Q5TC04 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP1A1-AS1Q5TC04 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP1A1-AS1Q5TC04 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP1A1-AS1Q5TC04 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP1A1-AS1Q5TC04 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP1A1-AS1Q5TC04 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A1-AS1Q5TC04 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A1-AS1Q5TC04 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A1-AS1Q5TC04 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP1A1-AS1Q5TC04 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP1A1-AS1Q5TC04 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP1A1-AS1Q5TC04 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A1-AS1Q5TC04 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP1A1-AS1Q5TC04 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A1-AS1Q5TC04 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A1-AS1Q5TC04 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A1-AS1Q5TC04 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A1-AS1Q5TC04 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP1A1-AS1Q5TC04 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1A1-AS1Q5TC04 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1A1-AS1Q5TC04 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1A1-AS1Q5TC04 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1A1-AS1Q5TC04 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP1A1-AS1Q5TC04 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A1-AS1Q5TC04 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A1-AS1Q5TC04 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP1A1-AS1Q5TC04 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A1-AS1Q5TC04 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A1-AS1Q5TC04 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A1-AS1Q5TC04 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A1-AS1Q5TC04 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A1-AS1Q5TC04 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A1-AS1Q5TC04 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A1-AS1Q5TC04 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A1-AS1Q5TC04 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A1-AS1Q5TC04 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1-AS1Q5TC04 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP1A1-AS1Q5TC04 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP1A1-AS1Q5TC04 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A1-AS1Q5TC04 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A1-AS1Q5TC04 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP1A1-AS1Q5TC04 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A1-AS1Q5TC04 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP1A1-AS1Q5TC04 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP1A1-AS1Q5TC04 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP1A1-AS1Q5TC04 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP1A1-AS1Q5TC04 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms