Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CRY2Q49AN0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CRY2Q49AN0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CRY2Q49AN0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CRY2Q49AN0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CRY2Q49AN0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
CRY2Q49AN0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CRY2Q49AN0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
CRY2Q49AN0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CRY2Q49AN0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CRY2Q49AN0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CRY2Q49AN0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CRY2Q49AN0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CRY2Q49AN0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CRY2Q49AN0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CRY2Q49AN0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CRY2Q49AN0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CRY2Q49AN0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CRY2Q49AN0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CRY2Q49AN0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CRY2Q49AN0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CRY2Q49AN0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CRY2Q49AN0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CRY2Q49AN0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CRY2Q49AN0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CRY2Q49AN0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CRY2Q49AN0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CRY2Q49AN0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CRY2Q49AN0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CRY2Q49AN0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CRY2Q49AN0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CRY2Q49AN0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CRY2Q49AN0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
CRY2Q49AN0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CRY2Q49AN0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CRY2Q49AN0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CRY2Q49AN0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
CRY2Q49AN0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CRY2Q49AN0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CRY2Q49AN0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CRY2Q49AN0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CRY2Q49AN0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CRY2Q49AN0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CRY2Q49AN0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CRY2Q49AN0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CRY2Q49AN0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CRY2Q49AN0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CRY2Q49AN0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CRY2Q49AN0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CRY2Q49AN0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CRY2Q49AN0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CRY2Q49AN0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CRY2Q49AN0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CRY2Q49AN0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CRY2Q49AN0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CRY2Q49AN0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CRY2Q49AN0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CRY2Q49AN0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CRY2Q49AN0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CRY2Q49AN0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CRY2Q49AN0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CRY2Q49AN0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CRY2Q49AN0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CRY2Q49AN0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CRY2Q49AN0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CRY2Q49AN0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CRY2Q49AN0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CRY2Q49AN0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CRY2Q49AN0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CRY2Q49AN0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CRY2Q49AN0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CRY2Q49AN0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CRY2Q49AN0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CRY2Q49AN0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CRY2Q49AN0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CRY2Q49AN0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CRY2Q49AN0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CRY2Q49AN0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CRY2Q49AN0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CRY2Q49AN0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CRY2Q49AN0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CRY2Q49AN0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CRY2Q49AN0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CRY2Q49AN0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CRY2Q49AN0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
CRY2Q49AN0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CRY2Q49AN0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CRY2Q49AN0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CRY2Q49AN0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CRY2Q49AN0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CRY2Q49AN0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CRY2Q49AN0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CRY2Q49AN0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms