Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TSGA10IPQ3SY00 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TSGA10IPQ3SY00 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
TSGA10IPQ3SY00 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TSGA10IPQ3SY00 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TSGA10IPQ3SY00 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
TSGA10IPQ3SY00 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TSGA10IPQ3SY00 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TSGA10IPQ3SY00 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TSGA10IPQ3SY00 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TSGA10IPQ3SY00 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TSGA10IPQ3SY00 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TSGA10IPQ3SY00 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TSGA10IPQ3SY00 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TSGA10IPQ3SY00 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TSGA10IPQ3SY00 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TSGA10IPQ3SY00 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TSGA10IPQ3SY00 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TSGA10IPQ3SY00 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TSGA10IPQ3SY00 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TSGA10IPQ3SY00 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TSGA10IPQ3SY00 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TSGA10IPQ3SY00 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TSGA10IPQ3SY00 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TSGA10IPQ3SY00 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TSGA10IPQ3SY00 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TSGA10IPQ3SY00 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TSGA10IPQ3SY00 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TSGA10IPQ3SY00 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TSGA10IPQ3SY00 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TSGA10IPQ3SY00 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TSGA10IPQ3SY00 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TSGA10IPQ3SY00 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TSGA10IPQ3SY00 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TSGA10IPQ3SY00 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TSGA10IPQ3SY00 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TSGA10IPQ3SY00 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TSGA10IPQ3SY00 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TSGA10IPQ3SY00 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TSGA10IPQ3SY00 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TSGA10IPQ3SY00 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TSGA10IPQ3SY00 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TSGA10IPQ3SY00 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TSGA10IPQ3SY00 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TSGA10IPQ3SY00 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TSGA10IPQ3SY00 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TSGA10IPQ3SY00 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TSGA10IPQ3SY00 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TSGA10IPQ3SY00 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TSGA10IPQ3SY00 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TSGA10IPQ3SY00 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TSGA10IPQ3SY00 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TSGA10IPQ3SY00 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TSGA10IPQ3SY00 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TSGA10IPQ3SY00 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TSGA10IPQ3SY00 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TSGA10IPQ3SY00 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TSGA10IPQ3SY00 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TSGA10IPQ3SY00 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TSGA10IPQ3SY00 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TSGA10IPQ3SY00 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TSGA10IPQ3SY00 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TSGA10IPQ3SY00 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TSGA10IPQ3SY00 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TSGA10IPQ3SY00 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TSGA10IPQ3SY00 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TSGA10IPQ3SY00 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
TSGA10IPQ3SY00 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TSGA10IPQ3SY00 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TSGA10IPQ3SY00 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TSGA10IPQ3SY00 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TSGA10IPQ3SY00 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TSGA10IPQ3SY00 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TSGA10IPQ3SY00 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TSGA10IPQ3SY00 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TSGA10IPQ3SY00 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TSGA10IPQ3SY00 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TSGA10IPQ3SY00 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TSGA10IPQ3SY00 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TSGA10IPQ3SY00 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TSGA10IPQ3SY00 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TSGA10IPQ3SY00 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TSGA10IPQ3SY00 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TSGA10IPQ3SY00 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TSGA10IPQ3SY00 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TSGA10IPQ3SY00 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TSGA10IPQ3SY00 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TSGA10IPQ3SY00 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TSGA10IPQ3SY00 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TSGA10IPQ3SY00 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TSGA10IPQ3SY00 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TSGA10IPQ3SY00 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TSGA10IPQ3SY00 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TSGA10IPQ3SY00 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TSGA10IPQ3SY00 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TSGA10IPQ3SY00 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TSGA10IPQ3SY00 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TSGA10IPQ3SY00 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TSGA10IPQ3SY00 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TSGA10IPQ3SY00 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms