Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TYSND1Q2T9J0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TYSND1Q2T9J0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TYSND1Q2T9J0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TYSND1Q2T9J0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TYSND1Q2T9J0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TYSND1Q2T9J0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TYSND1Q2T9J0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TYSND1Q2T9J0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TYSND1Q2T9J0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TYSND1Q2T9J0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TYSND1Q2T9J0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TYSND1Q2T9J0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TYSND1Q2T9J0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TYSND1Q2T9J0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TYSND1Q2T9J0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TYSND1Q2T9J0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TYSND1Q2T9J0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TYSND1Q2T9J0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TYSND1Q2T9J0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TYSND1Q2T9J0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TYSND1Q2T9J0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TYSND1Q2T9J0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TYSND1Q2T9J0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TYSND1Q2T9J0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TYSND1Q2T9J0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TYSND1Q2T9J0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TYSND1Q2T9J0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TYSND1Q2T9J0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TYSND1Q2T9J0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TYSND1Q2T9J0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TYSND1Q2T9J0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TYSND1Q2T9J0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TYSND1Q2T9J0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TYSND1Q2T9J0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TYSND1Q2T9J0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TYSND1Q2T9J0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TYSND1Q2T9J0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TYSND1Q2T9J0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TYSND1Q2T9J0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TYSND1Q2T9J0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TYSND1Q2T9J0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TYSND1Q2T9J0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TYSND1Q2T9J0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TYSND1Q2T9J0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TYSND1Q2T9J0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TYSND1Q2T9J0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TYSND1Q2T9J0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TYSND1Q2T9J0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TYSND1Q2T9J0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TYSND1Q2T9J0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TYSND1Q2T9J0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TYSND1Q2T9J0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TYSND1Q2T9J0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TYSND1Q2T9J0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TYSND1Q2T9J0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TYSND1Q2T9J0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TYSND1Q2T9J0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TYSND1Q2T9J0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TYSND1Q2T9J0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TYSND1Q2T9J0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TYSND1Q2T9J0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TYSND1Q2T9J0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TYSND1Q2T9J0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TYSND1Q2T9J0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TYSND1Q2T9J0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TYSND1Q2T9J0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TYSND1Q2T9J0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TYSND1Q2T9J0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TYSND1Q2T9J0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TYSND1Q2T9J0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TYSND1Q2T9J0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TYSND1Q2T9J0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TYSND1Q2T9J0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TYSND1Q2T9J0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TYSND1Q2T9J0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TYSND1Q2T9J0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TYSND1Q2T9J0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TYSND1Q2T9J0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TYSND1Q2T9J0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TYSND1Q2T9J0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TYSND1Q2T9J0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TYSND1Q2T9J0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TYSND1Q2T9J0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TYSND1Q2T9J0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TYSND1Q2T9J0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TYSND1Q2T9J0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TYSND1Q2T9J0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TYSND1Q2T9J0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TYSND1Q2T9J0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TYSND1Q2T9J0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYSND1Q2T9J0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYSND1Q2T9J0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TYSND1Q2T9J0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TYSND1Q2T9J0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TYSND1Q2T9J0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TYSND1Q2T9J0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TYSND1Q2T9J0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TYSND1Q2T9J0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TYSND1Q2T9J0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms