Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GSG1Q2KHT4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSG1Q2KHT4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GSG1Q2KHT4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GSG1Q2KHT4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSG1Q2KHT4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GSG1Q2KHT4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSG1Q2KHT4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GSG1Q2KHT4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSG1Q2KHT4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSG1Q2KHT4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSG1Q2KHT4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GSG1Q2KHT4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSG1Q2KHT4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GSG1Q2KHT4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSG1Q2KHT4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSG1Q2KHT4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSG1Q2KHT4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSG1Q2KHT4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSG1Q2KHT4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSG1Q2KHT4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSG1Q2KHT4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSG1Q2KHT4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSG1Q2KHT4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSG1Q2KHT4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSG1Q2KHT4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSG1Q2KHT4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSG1Q2KHT4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSG1Q2KHT4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSG1Q2KHT4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GSG1Q2KHT4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GSG1Q2KHT4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSG1Q2KHT4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSG1Q2KHT4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSG1Q2KHT4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSG1Q2KHT4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSG1Q2KHT4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSG1Q2KHT4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSG1Q2KHT4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSG1Q2KHT4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSG1Q2KHT4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSG1Q2KHT4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSG1Q2KHT4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSG1Q2KHT4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSG1Q2KHT4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSG1Q2KHT4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSG1Q2KHT4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSG1Q2KHT4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSG1Q2KHT4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSG1Q2KHT4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSG1Q2KHT4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSG1Q2KHT4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSG1Q2KHT4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSG1Q2KHT4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSG1Q2KHT4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSG1Q2KHT4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSG1Q2KHT4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GSG1Q2KHT4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSG1Q2KHT4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSG1Q2KHT4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSG1Q2KHT4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSG1Q2KHT4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSG1Q2KHT4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSG1Q2KHT4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSG1Q2KHT4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSG1Q2KHT4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GSG1Q2KHT4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSG1Q2KHT4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSG1Q2KHT4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSG1Q2KHT4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSG1Q2KHT4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSG1Q2KHT4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSG1Q2KHT4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSG1Q2KHT4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSG1Q2KHT4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSG1Q2KHT4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSG1Q2KHT4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSG1Q2KHT4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSG1Q2KHT4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSG1Q2KHT4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSG1Q2KHT4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSG1Q2KHT4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSG1Q2KHT4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSG1Q2KHT4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSG1Q2KHT4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GSG1Q2KHT4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSG1Q2KHT4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSG1Q2KHT4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSG1Q2KHT4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSG1Q2KHT4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSG1Q2KHT4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSG1Q2KHT4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GSG1Q2KHT4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSG1Q2KHT4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSG1Q2KHT4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSG1Q2KHT4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GSG1Q2KHT4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSG1Q2KHT4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSG1Q2KHT4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSG1Q2KHT4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms