Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HIST2H2ACQ16777 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HIST2H2ACQ16777 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
HIST2H2ACQ16777 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIST2H2ACQ16777 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIST2H2ACQ16777 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HIST2H2ACQ16777 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIST2H2ACQ16777 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HIST2H2ACQ16777 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HIST2H2ACQ16777 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
HIST2H2ACQ16777 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIST2H2ACQ16777 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIST2H2ACQ16777 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIST2H2ACQ16777 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIST2H2ACQ16777 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIST2H2ACQ16777 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIST2H2ACQ16777 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIST2H2ACQ16777 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIST2H2ACQ16777 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIST2H2ACQ16777 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIST2H2ACQ16777 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
HIST2H2ACQ16777 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIST2H2ACQ16777 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HIST2H2ACQ16777 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIST2H2ACQ16777 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HIST2H2ACQ16777 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HIST2H2ACQ16777 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HIST2H2ACQ16777 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HIST2H2ACQ16777 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HIST2H2ACQ16777 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIST2H2ACQ16777 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIST2H2ACQ16777 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIST2H2ACQ16777 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIST2H2ACQ16777 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIST2H2ACQ16777 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIST2H2ACQ16777 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIST2H2ACQ16777 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIST2H2ACQ16777 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIST2H2ACQ16777 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HIST2H2ACQ16777 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HIST2H2ACQ16777 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HIST2H2ACQ16777 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HIST2H2ACQ16777 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HIST2H2ACQ16777 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIST2H2ACQ16777 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIST2H2ACQ16777 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIST2H2ACQ16777 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIST2H2ACQ16777 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIST2H2ACQ16777 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIST2H2ACQ16777 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIST2H2ACQ16777 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HIST2H2ACQ16777 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HIST2H2ACQ16777 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HIST2H2ACQ16777 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIST2H2ACQ16777 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HIST2H2ACQ16777 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HIST2H2ACQ16777 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HIST2H2ACQ16777 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HIST2H2ACQ16777 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIST2H2ACQ16777 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIST2H2ACQ16777 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIST2H2ACQ16777 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIST2H2ACQ16777 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIST2H2ACQ16777 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIST2H2ACQ16777 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIST2H2ACQ16777 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIST2H2ACQ16777 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIST2H2ACQ16777 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIST2H2ACQ16777 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIST2H2ACQ16777 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIST2H2ACQ16777 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIST2H2ACQ16777 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIST2H2ACQ16777 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIST2H2ACQ16777 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIST2H2ACQ16777 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIST2H2ACQ16777 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIST2H2ACQ16777 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIST2H2ACQ16777 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIST2H2ACQ16777 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIST2H2ACQ16777 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HIST2H2ACQ16777 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIST2H2ACQ16777 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIST2H2ACQ16777 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIST2H2ACQ16777 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIST2H2ACQ16777 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIST2H2ACQ16777 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIST2H2ACQ16777 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIST2H2ACQ16777 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HIST2H2ACQ16777 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIST2H2ACQ16777 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIST2H2ACQ16777 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIST2H2ACQ16777 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIST2H2ACQ16777 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HIST2H2ACQ16777 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HIST2H2ACQ16777 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HIST2H2ACQ16777 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HIST2H2ACQ16777 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HIST2H2ACQ16777 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HIST2H2ACQ16777 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HIST2H2ACQ16777 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms