Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CEBPEQ15744 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CEBPEQ15744 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CEBPEQ15744 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CEBPEQ15744 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CEBPEQ15744 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CEBPEQ15744 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CEBPEQ15744 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CEBPEQ15744 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CEBPEQ15744 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEBPEQ15744 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CEBPEQ15744 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEBPEQ15744 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEBPEQ15744 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEBPEQ15744 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEBPEQ15744 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEBPEQ15744 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEBPEQ15744 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEBPEQ15744 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEBPEQ15744 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEBPEQ15744 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEBPEQ15744 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEBPEQ15744 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEBPEQ15744 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEBPEQ15744 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEBPEQ15744 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CEBPEQ15744 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CEBPEQ15744 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CEBPEQ15744 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CEBPEQ15744 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CEBPEQ15744 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CEBPEQ15744 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEBPEQ15744 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEBPEQ15744 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEBPEQ15744 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEBPEQ15744 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEBPEQ15744 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CEBPEQ15744 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEBPEQ15744 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEBPEQ15744 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEBPEQ15744 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEBPEQ15744 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEBPEQ15744 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEBPEQ15744 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEBPEQ15744 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEBPEQ15744 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEBPEQ15744 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEBPEQ15744 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEBPEQ15744 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEBPEQ15744 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEBPEQ15744 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEBPEQ15744 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEBPEQ15744 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEBPEQ15744 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEBPEQ15744 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEBPEQ15744 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEBPEQ15744 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEBPEQ15744 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEBPEQ15744 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEBPEQ15744 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEBPEQ15744 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEBPEQ15744 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEBPEQ15744 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CEBPEQ15744 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CEBPEQ15744 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEBPEQ15744 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CEBPEQ15744 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CEBPEQ15744 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CEBPEQ15744 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CEBPEQ15744 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CEBPEQ15744 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CEBPEQ15744 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEBPEQ15744 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CEBPEQ15744 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEBPEQ15744 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEBPEQ15744 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEBPEQ15744 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CEBPEQ15744 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEBPEQ15744 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEBPEQ15744 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEBPEQ15744 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEBPEQ15744 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEBPEQ15744 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEBPEQ15744 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEBPEQ15744 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CEBPEQ15744 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEBPEQ15744 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEBPEQ15744 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEBPEQ15744 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEBPEQ15744 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEBPEQ15744 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEBPEQ15744 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEBPEQ15744 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CEBPEQ15744 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEBPEQ15744 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEBPEQ15744 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEBPEQ15744 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEBPEQ15744 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEBPEQ15744 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEBPEQ15744 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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