Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PDE3AQ14432 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.06■■■■■ 4.48
PDE3AQ14432 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
PDE3AQ14432 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PDE3AQ14432 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PDE3AQ14432 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
PDE3AQ14432 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PDE3AQ14432 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
PDE3AQ14432 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PDE3AQ14432 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PDE3AQ14432 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PDE3AQ14432 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PDE3AQ14432 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PDE3AQ14432 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PDE3AQ14432 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PDE3AQ14432 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PDE3AQ14432 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
PDE3AQ14432 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PDE3AQ14432 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PDE3AQ14432 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PDE3AQ14432 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PDE3AQ14432 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PDE3AQ14432 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PDE3AQ14432 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PDE3AQ14432 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PDE3AQ14432 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PDE3AQ14432 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDE3AQ14432 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDE3AQ14432 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PDE3AQ14432 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PDE3AQ14432 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDE3AQ14432 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PDE3AQ14432 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
PDE3AQ14432 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PDE3AQ14432 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PDE3AQ14432 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PDE3AQ14432 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
PDE3AQ14432 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PDE3AQ14432 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PDE3AQ14432 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PDE3AQ14432 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDE3AQ14432 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PDE3AQ14432 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PDE3AQ14432 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PDE3AQ14432 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PDE3AQ14432 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDE3AQ14432 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PDE3AQ14432 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PDE3AQ14432 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PDE3AQ14432 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PDE3AQ14432 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PDE3AQ14432 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PDE3AQ14432 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PDE3AQ14432 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDE3AQ14432 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDE3AQ14432 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDE3AQ14432 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PDE3AQ14432 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDE3AQ14432 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDE3AQ14432 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDE3AQ14432 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PDE3AQ14432 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDE3AQ14432 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDE3AQ14432 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PDE3AQ14432 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PDE3AQ14432 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDE3AQ14432 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDE3AQ14432 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDE3AQ14432 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PDE3AQ14432 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PDE3AQ14432 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PDE3AQ14432 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDE3AQ14432 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDE3AQ14432 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDE3AQ14432 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDE3AQ14432 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDE3AQ14432 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
PDE3AQ14432 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDE3AQ14432 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PDE3AQ14432 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PDE3AQ14432 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PDE3AQ14432 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDE3AQ14432 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PDE3AQ14432 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDE3AQ14432 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDE3AQ14432 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDE3AQ14432 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PDE3AQ14432 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDE3AQ14432 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDE3AQ14432 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PDE3AQ14432 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PDE3AQ14432 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PDE3AQ14432 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDE3AQ14432 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDE3AQ14432 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PDE3AQ14432 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PDE3AQ14432 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PDE3AQ14432 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PDE3AQ14432 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PDE3AQ14432 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms