Protein–RNA interactions for Protein: Q09327

MGAT3, Beta-1,4-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT3Q09327 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MGAT3Q09327 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MGAT3Q09327 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MGAT3Q09327 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MGAT3Q09327 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
MGAT3Q09327 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MGAT3Q09327 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MGAT3Q09327 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
MGAT3Q09327 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MGAT3Q09327 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
MGAT3Q09327 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MGAT3Q09327 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MGAT3Q09327 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MGAT3Q09327 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MGAT3Q09327 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
MGAT3Q09327 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MGAT3Q09327 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MGAT3Q09327 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MGAT3Q09327 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MGAT3Q09327 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MGAT3Q09327 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MGAT3Q09327 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MGAT3Q09327 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MGAT3Q09327 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MGAT3Q09327 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MGAT3Q09327 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MGAT3Q09327 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MGAT3Q09327 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MGAT3Q09327 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MGAT3Q09327 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MGAT3Q09327 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MGAT3Q09327 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MGAT3Q09327 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MGAT3Q09327 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MGAT3Q09327 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34■■■■□ 3.03
MGAT3Q09327 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MGAT3Q09327 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MGAT3Q09327 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MGAT3Q09327 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
MGAT3Q09327 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
MGAT3Q09327 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MGAT3Q09327 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
MGAT3Q09327 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MGAT3Q09327 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MGAT3Q09327 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MGAT3Q09327 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MGAT3Q09327 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MGAT3Q09327 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MGAT3Q09327 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MGAT3Q09327 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MGAT3Q09327 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MGAT3Q09327 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MGAT3Q09327 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MGAT3Q09327 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MGAT3Q09327 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MGAT3Q09327 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MGAT3Q09327 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MGAT3Q09327 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MGAT3Q09327 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MGAT3Q09327 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MGAT3Q09327 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MGAT3Q09327 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MGAT3Q09327 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MGAT3Q09327 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MGAT3Q09327 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MGAT3Q09327 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MGAT3Q09327 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MGAT3Q09327 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MGAT3Q09327 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MGAT3Q09327 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MGAT3Q09327 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MGAT3Q09327 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MGAT3Q09327 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MGAT3Q09327 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MGAT3Q09327 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MGAT3Q09327 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MGAT3Q09327 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MGAT3Q09327 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MGAT3Q09327 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MGAT3Q09327 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MGAT3Q09327 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
MGAT3Q09327 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MGAT3Q09327 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MGAT3Q09327 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MGAT3Q09327 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MGAT3Q09327 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MGAT3Q09327 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MGAT3Q09327 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MGAT3Q09327 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
MGAT3Q09327 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MGAT3Q09327 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MGAT3Q09327 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MGAT3Q09327 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms