Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.5
RBP5P82980 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RBP5P82980 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RBP5P82980 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RBP5P82980 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RBP5P82980 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RBP5P82980 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RBP5P82980 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RBP5P82980 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RBP5P82980 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RBP5P82980 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RBP5P82980 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RBP5P82980 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RBP5P82980 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RBP5P82980 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RBP5P82980 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RBP5P82980 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RBP5P82980 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RBP5P82980 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RBP5P82980 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RBP5P82980 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RBP5P82980 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RBP5P82980 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RBP5P82980 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RBP5P82980 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RBP5P82980 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RBP5P82980 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RBP5P82980 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RBP5P82980 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RBP5P82980 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RBP5P82980 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RBP5P82980 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RBP5P82980 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RBP5P82980 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RBP5P82980 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBP5P82980 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RBP5P82980 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RBP5P82980 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
RBP5P82980 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RBP5P82980 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RBP5P82980 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RBP5P82980 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RBP5P82980 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RBP5P82980 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RBP5P82980 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RBP5P82980 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RBP5P82980 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RBP5P82980 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RBP5P82980 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RBP5P82980 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RBP5P82980 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RBP5P82980 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RBP5P82980 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RBP5P82980 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RBP5P82980 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RBP5P82980 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RBP5P82980 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RBP5P82980 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RBP5P82980 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBP5P82980 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RBP5P82980 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RBP5P82980 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RBP5P82980 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RBP5P82980 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RBP5P82980 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RBP5P82980 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RBP5P82980 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBP5P82980 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBP5P82980 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBP5P82980 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBP5P82980 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBP5P82980 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RBP5P82980 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBP5P82980 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RBP5P82980 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBP5P82980 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBP5P82980 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RBP5P82980 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RBP5P82980 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RBP5P82980 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RBP5P82980 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RBP5P82980 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RBP5P82980 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RBP5P82980 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RBP5P82980 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RBP5P82980 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RBP5P82980 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RBP5P82980 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RBP5P82980 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RBP5P82980 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RBP5P82980 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RBP5P82980 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RBP5P82980 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RBP5P82980 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RBP5P82980 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RBP5P82980 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RBP5P82980 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RBP5P82980 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RBP5P82980 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RBP5P82980 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms