Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
IRX5P78411 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
IRX5P78411 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
IRX5P78411 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IRX5P78411 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IRX5P78411 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
IRX5P78411 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IRX5P78411 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
IRX5P78411 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
IRX5P78411 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IRX5P78411 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
IRX5P78411 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
IRX5P78411 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
IRX5P78411 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
IRX5P78411 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
IRX5P78411 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
IRX5P78411 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IRX5P78411 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
IRX5P78411 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
IRX5P78411 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IRX5P78411 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
IRX5P78411 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
IRX5P78411 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
IRX5P78411 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
IRX5P78411 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IRX5P78411 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
IRX5P78411 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IRX5P78411 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
IRX5P78411 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
IRX5P78411 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IRX5P78411 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IRX5P78411 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IRX5P78411 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IRX5P78411 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
IRX5P78411 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
IRX5P78411 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
IRX5P78411 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
IRX5P78411 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
IRX5P78411 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IRX5P78411 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
IRX5P78411 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
IRX5P78411 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
IRX5P78411 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IRX5P78411 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
IRX5P78411 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IRX5P78411 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
IRX5P78411 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IRX5P78411 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IRX5P78411 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IRX5P78411 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
IRX5P78411 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IRX5P78411 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
IRX5P78411 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IRX5P78411 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
IRX5P78411 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IRX5P78411 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
IRX5P78411 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IRX5P78411 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IRX5P78411 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IRX5P78411 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IRX5P78411 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IRX5P78411 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IRX5P78411 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IRX5P78411 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IRX5P78411 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IRX5P78411 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
IRX5P78411 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IRX5P78411 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
IRX5P78411 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IRX5P78411 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IRX5P78411 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
IRX5P78411 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IRX5P78411 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IRX5P78411 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IRX5P78411 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IRX5P78411 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IRX5P78411 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IRX5P78411 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IRX5P78411 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IRX5P78411 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IRX5P78411 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
IRX5P78411 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
IRX5P78411 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
IRX5P78411 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IRX5P78411 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IRX5P78411 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
IRX5P78411 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IRX5P78411 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IRX5P78411 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IRX5P78411 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
IRX5P78411 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IRX5P78411 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IRX5P78411 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IRX5P78411 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IRX5P78411 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IRX5P78411 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IRX5P78411 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IRX5P78411 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
IRX5P78411 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
IRX5P78411 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms