Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPL23AP62750 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPL23AP62750 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL23AP62750 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL23AP62750 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPL23AP62750 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPL23AP62750 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPL23AP62750 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPL23AP62750 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL23AP62750 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL23AP62750 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL23AP62750 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL23AP62750 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL23AP62750 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL23AP62750 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL23AP62750 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL23AP62750 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL23AP62750 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL23AP62750 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL23AP62750 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL23AP62750 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPL23AP62750 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL23AP62750 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPL23AP62750 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL23AP62750 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL23AP62750 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL23AP62750 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL23AP62750 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL23AP62750 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL23AP62750 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL23AP62750 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL23AP62750 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL23AP62750 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPL23AP62750 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL23AP62750 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL23AP62750 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL23AP62750 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL23AP62750 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL23AP62750 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL23AP62750 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL23AP62750 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL23AP62750 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL23AP62750 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL23AP62750 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPL23AP62750 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL23AP62750 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL23AP62750 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL23AP62750 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL23AP62750 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL23AP62750 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL23AP62750 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL23AP62750 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL23AP62750 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL23AP62750 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL23AP62750 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL23AP62750 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL23AP62750 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL23AP62750 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL23AP62750 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL23AP62750 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL23AP62750 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL23AP62750 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL23AP62750 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL23AP62750 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL23AP62750 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL23AP62750 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL23AP62750 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL23AP62750 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL23AP62750 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL23AP62750 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL23AP62750 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL23AP62750 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL23AP62750 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL23AP62750 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL23AP62750 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL23AP62750 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL23AP62750 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL23AP62750 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL23AP62750 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL23AP62750 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL23AP62750 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL23AP62750 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL23AP62750 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL23AP62750 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL23AP62750 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL23AP62750 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL23AP62750 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL23AP62750 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL23AP62750 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL23AP62750 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL23AP62750 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL23AP62750 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL23AP62750 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL23AP62750 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL23AP62750 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL23AP62750 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL23AP62750 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL23AP62750 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL23AP62750 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL23AP62750 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms