Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CSE1LP55060 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSE1LP55060 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CSE1LP55060 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CSE1LP55060 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CSE1LP55060 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CSE1LP55060 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CSE1LP55060 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CSE1LP55060 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSE1LP55060 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CSE1LP55060 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CSE1LP55060 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CSE1LP55060 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSE1LP55060 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CSE1LP55060 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CSE1LP55060 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CSE1LP55060 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CSE1LP55060 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CSE1LP55060 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CSE1LP55060 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CSE1LP55060 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CSE1LP55060 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CSE1LP55060 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CSE1LP55060 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CSE1LP55060 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CSE1LP55060 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CSE1LP55060 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CSE1LP55060 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CSE1LP55060 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CSE1LP55060 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSE1LP55060 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSE1LP55060 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CSE1LP55060 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CSE1LP55060 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CSE1LP55060 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSE1LP55060 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSE1LP55060 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSE1LP55060 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CSE1LP55060 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CSE1LP55060 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CSE1LP55060 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSE1LP55060 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CSE1LP55060 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CSE1LP55060 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSE1LP55060 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSE1LP55060 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CSE1LP55060 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSE1LP55060 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSE1LP55060 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSE1LP55060 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSE1LP55060 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSE1LP55060 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSE1LP55060 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSE1LP55060 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSE1LP55060 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSE1LP55060 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSE1LP55060 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSE1LP55060 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSE1LP55060 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSE1LP55060 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSE1LP55060 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSE1LP55060 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSE1LP55060 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSE1LP55060 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSE1LP55060 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CSE1LP55060 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSE1LP55060 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSE1LP55060 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSE1LP55060 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSE1LP55060 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSE1LP55060 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSE1LP55060 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSE1LP55060 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSE1LP55060 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSE1LP55060 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSE1LP55060 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSE1LP55060 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSE1LP55060 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSE1LP55060 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CSE1LP55060 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSE1LP55060 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSE1LP55060 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CSE1LP55060 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSE1LP55060 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSE1LP55060 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CSE1LP55060 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSE1LP55060 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSE1LP55060 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSE1LP55060 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CSE1LP55060 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CSE1LP55060 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CSE1LP55060 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms