Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HALP42357 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HALP42357 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HALP42357 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HALP42357 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HALP42357 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HALP42357 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HALP42357 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HALP42357 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HALP42357 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HALP42357 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HALP42357 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HALP42357 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HALP42357 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HALP42357 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HALP42357 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HALP42357 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HALP42357 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HALP42357 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HALP42357 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
HALP42357 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HALP42357 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HALP42357 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HALP42357 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HALP42357 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HALP42357 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HALP42357 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HALP42357 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HALP42357 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HALP42357 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HALP42357 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HALP42357 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HALP42357 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HALP42357 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HALP42357 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
HALP42357 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HALP42357 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HALP42357 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HALP42357 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HALP42357 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HALP42357 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HALP42357 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HALP42357 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HALP42357 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HALP42357 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HALP42357 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HALP42357 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HALP42357 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HALP42357 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HALP42357 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HALP42357 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HALP42357 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HALP42357 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HALP42357 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HALP42357 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HALP42357 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HALP42357 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HALP42357 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HALP42357 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HALP42357 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HALP42357 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HALP42357 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HALP42357 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HALP42357 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HALP42357 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HALP42357 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HALP42357 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HALP42357 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HALP42357 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HALP42357 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HALP42357 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HALP42357 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HALP42357 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HALP42357 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HALP42357 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HALP42357 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HALP42357 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HALP42357 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HALP42357 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HALP42357 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HALP42357 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HALP42357 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HALP42357 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HALP42357 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HALP42357 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HALP42357 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HALP42357 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HALP42357 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HALP42357 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HALP42357 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HALP42357 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HALP42357 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HALP42357 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HALP42357 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HALP42357 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HALP42357 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HALP42357 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HALP42357 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HALP42357 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HALP42357 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms