Protein–RNA interactions for Protein: P41226

UBA7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA7P41226 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
UBA7P41226 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
UBA7P41226 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
UBA7P41226 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
UBA7P41226 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBA7P41226 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBA7P41226 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
UBA7P41226 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
UBA7P41226 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
UBA7P41226 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
UBA7P41226 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
UBA7P41226 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
UBA7P41226 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
UBA7P41226 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
UBA7P41226 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
UBA7P41226 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
UBA7P41226 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBA7P41226 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
UBA7P41226 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
UBA7P41226 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
UBA7P41226 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
UBA7P41226 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
UBA7P41226 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
UBA7P41226 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
UBA7P41226 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
UBA7P41226 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
UBA7P41226 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
UBA7P41226 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
UBA7P41226 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
UBA7P41226 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
UBA7P41226 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
UBA7P41226 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
UBA7P41226 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
UBA7P41226 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
UBA7P41226 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
UBA7P41226 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
UBA7P41226 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
UBA7P41226 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
UBA7P41226 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
UBA7P41226 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
UBA7P41226 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBA7P41226 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UBA7P41226 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBA7P41226 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
UBA7P41226 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBA7P41226 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBA7P41226 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBA7P41226 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBA7P41226 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBA7P41226 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UBA7P41226 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UBA7P41226 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBA7P41226 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBA7P41226 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBA7P41226 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBA7P41226 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
UBA7P41226 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBA7P41226 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBA7P41226 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBA7P41226 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBA7P41226 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBA7P41226 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
UBA7P41226 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UBA7P41226 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UBA7P41226 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
UBA7P41226 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBA7P41226 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UBA7P41226 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UBA7P41226 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
UBA7P41226 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
UBA7P41226 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UBA7P41226 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
UBA7P41226 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
UBA7P41226 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
UBA7P41226 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
UBA7P41226 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
UBA7P41226 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
UBA7P41226 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
UBA7P41226 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
UBA7P41226 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
UBA7P41226 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
UBA7P41226 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
UBA7P41226 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
UBA7P41226 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UBA7P41226 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UBA7P41226 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UBA7P41226 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
UBA7P41226 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
UBA7P41226 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
UBA7P41226 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UBA7P41226 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
UBA7P41226 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBA7P41226 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UBA7P41226 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UBA7P41226 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
UBA7P41226 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
UBA7P41226 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
UBA7P41226 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
UBA7P41226 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
UBA7P41226 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms