Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.28■■■■■ 4.68
COL15A1P39059 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
COL15A1P39059 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
COL15A1P39059 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
COL15A1P39059 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
COL15A1P39059 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
COL15A1P39059 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
COL15A1P39059 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
COL15A1P39059 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
COL15A1P39059 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
COL15A1P39059 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
COL15A1P39059 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
COL15A1P39059 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
COL15A1P39059 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
COL15A1P39059 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
COL15A1P39059 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
COL15A1P39059 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
COL15A1P39059 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
COL15A1P39059 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
COL15A1P39059 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
COL15A1P39059 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
COL15A1P39059 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
COL15A1P39059 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
COL15A1P39059 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
COL15A1P39059 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
COL15A1P39059 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
COL15A1P39059 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
COL15A1P39059 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
COL15A1P39059 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
COL15A1P39059 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
COL15A1P39059 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
COL15A1P39059 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
COL15A1P39059 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
COL15A1P39059 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
COL15A1P39059 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
COL15A1P39059 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
COL15A1P39059 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
COL15A1P39059 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
COL15A1P39059 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
COL15A1P39059 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
COL15A1P39059 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
COL15A1P39059 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
COL15A1P39059 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
COL15A1P39059 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
COL15A1P39059 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
COL15A1P39059 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
COL15A1P39059 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
COL15A1P39059 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
COL15A1P39059 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
COL15A1P39059 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
COL15A1P39059 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
COL15A1P39059 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
COL15A1P39059 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
COL15A1P39059 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
COL15A1P39059 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
COL15A1P39059 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
COL15A1P39059 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
COL15A1P39059 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
COL15A1P39059 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
COL15A1P39059 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
COL15A1P39059 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
COL15A1P39059 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
COL15A1P39059 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
COL15A1P39059 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
COL15A1P39059 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
COL15A1P39059 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
COL15A1P39059 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
COL15A1P39059 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
COL15A1P39059 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
COL15A1P39059 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
COL15A1P39059 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
COL15A1P39059 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
COL15A1P39059 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
COL15A1P39059 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
COL15A1P39059 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
COL15A1P39059 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
COL15A1P39059 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
COL15A1P39059 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
COL15A1P39059 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
COL15A1P39059 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
COL15A1P39059 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
COL15A1P39059 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
COL15A1P39059 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
COL15A1P39059 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
COL15A1P39059 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
COL15A1P39059 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
COL15A1P39059 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
COL15A1P39059 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
COL15A1P39059 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
COL15A1P39059 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
COL15A1P39059 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
COL15A1P39059 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
COL15A1P39059 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms