Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RYKP34925 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RYKP34925 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RYKP34925 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RYKP34925 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RYKP34925 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RYKP34925 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RYKP34925 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RYKP34925 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RYKP34925 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RYKP34925 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RYKP34925 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RYKP34925 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RYKP34925 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RYKP34925 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RYKP34925 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RYKP34925 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RYKP34925 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RYKP34925 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RYKP34925 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RYKP34925 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RYKP34925 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RYKP34925 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RYKP34925 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RYKP34925 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RYKP34925 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RYKP34925 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RYKP34925 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RYKP34925 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RYKP34925 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RYKP34925 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RYKP34925 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RYKP34925 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RYKP34925 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RYKP34925 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RYKP34925 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RYKP34925 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RYKP34925 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RYKP34925 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RYKP34925 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RYKP34925 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RYKP34925 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RYKP34925 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RYKP34925 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RYKP34925 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RYKP34925 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RYKP34925 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RYKP34925 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RYKP34925 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RYKP34925 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RYKP34925 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RYKP34925 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RYKP34925 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RYKP34925 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RYKP34925 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RYKP34925 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RYKP34925 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RYKP34925 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RYKP34925 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RYKP34925 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RYKP34925 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RYKP34925 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RYKP34925 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RYKP34925 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RYKP34925 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RYKP34925 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RYKP34925 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RYKP34925 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RYKP34925 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RYKP34925 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RYKP34925 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RYKP34925 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RYKP34925 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RYKP34925 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RYKP34925 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RYKP34925 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RYKP34925 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RYKP34925 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RYKP34925 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RYKP34925 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RYKP34925 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RYKP34925 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RYKP34925 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RYKP34925 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RYKP34925 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RYKP34925 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RYKP34925 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RYKP34925 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RYKP34925 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RYKP34925 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RYKP34925 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RYKP34925 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RYKP34925 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RYKP34925 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RYKP34925 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RYKP34925 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RYKP34925 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RYKP34925 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RYKP34925 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RYKP34925 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms