Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PCMT1P22061 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PCMT1P22061 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCMT1P22061 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCMT1P22061 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCMT1P22061 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCMT1P22061 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCMT1P22061 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCMT1P22061 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCMT1P22061 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCMT1P22061 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCMT1P22061 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCMT1P22061 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCMT1P22061 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCMT1P22061 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PCMT1P22061 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCMT1P22061 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCMT1P22061 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCMT1P22061 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCMT1P22061 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCMT1P22061 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCMT1P22061 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCMT1P22061 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCMT1P22061 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCMT1P22061 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCMT1P22061 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCMT1P22061 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCMT1P22061 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCMT1P22061 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCMT1P22061 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCMT1P22061 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCMT1P22061 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCMT1P22061 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCMT1P22061 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCMT1P22061 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCMT1P22061 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCMT1P22061 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCMT1P22061 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCMT1P22061 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCMT1P22061 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCMT1P22061 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCMT1P22061 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCMT1P22061 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PCMT1P22061 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCMT1P22061 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCMT1P22061 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCMT1P22061 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCMT1P22061 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCMT1P22061 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCMT1P22061 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCMT1P22061 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCMT1P22061 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCMT1P22061 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCMT1P22061 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCMT1P22061 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCMT1P22061 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCMT1P22061 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCMT1P22061 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCMT1P22061 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCMT1P22061 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCMT1P22061 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMT1P22061 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMT1P22061 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCMT1P22061 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCMT1P22061 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMT1P22061 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMT1P22061 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCMT1P22061 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCMT1P22061 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCMT1P22061 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCMT1P22061 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMT1P22061 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMT1P22061 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMT1P22061 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCMT1P22061 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMT1P22061 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCMT1P22061 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCMT1P22061 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCMT1P22061 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCMT1P22061 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMT1P22061 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCMT1P22061 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMT1P22061 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCMT1P22061 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCMT1P22061 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCMT1P22061 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCMT1P22061 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCMT1P22061 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCMT1P22061 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCMT1P22061 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCMT1P22061 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCMT1P22061 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms