Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.5■■■■■ 5.03
ERBB3P21860 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
ERBB3P21860 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
ERBB3P21860 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ERBB3P21860 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
ERBB3P21860 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ERBB3P21860 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ERBB3P21860 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
ERBB3P21860 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ERBB3P21860 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ERBB3P21860 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
ERBB3P21860 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
ERBB3P21860 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ERBB3P21860 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ERBB3P21860 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ERBB3P21860 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ERBB3P21860 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ERBB3P21860 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ERBB3P21860 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ERBB3P21860 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.46
ERBB3P21860 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ERBB3P21860 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ERBB3P21860 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ERBB3P21860 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ERBB3P21860 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ERBB3P21860 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ERBB3P21860 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ERBB3P21860 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ERBB3P21860 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ERBB3P21860 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
ERBB3P21860 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ERBB3P21860 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
ERBB3P21860 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ERBB3P21860 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
ERBB3P21860 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
ERBB3P21860 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
ERBB3P21860 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
ERBB3P21860 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ERBB3P21860 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ERBB3P21860 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ERBB3P21860 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ERBB3P21860 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ERBB3P21860 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ERBB3P21860 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ERBB3P21860 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ERBB3P21860 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ERBB3P21860 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ERBB3P21860 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ERBB3P21860 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ERBB3P21860 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ERBB3P21860 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
ERBB3P21860 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERBB3P21860 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ERBB3P21860 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ERBB3P21860 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ERBB3P21860 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ERBB3P21860 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ERBB3P21860 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ERBB3P21860 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ERBB3P21860 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ERBB3P21860 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERBB3P21860 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERBB3P21860 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ERBB3P21860 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERBB3P21860 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ERBB3P21860 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ERBB3P21860 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERBB3P21860 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ERBB3P21860 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ERBB3P21860 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ERBB3P21860 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ERBB3P21860 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
ERBB3P21860 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ERBB3P21860 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERBB3P21860 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ERBB3P21860 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
ERBB3P21860 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERBB3P21860 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERBB3P21860 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ERBB3P21860 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ERBB3P21860 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ERBB3P21860 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ERBB3P21860 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ERBB3P21860 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ERBB3P21860 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
ERBB3P21860 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ERBB3P21860 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ERBB3P21860 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
ERBB3P21860 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ERBB3P21860 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ERBB3P21860 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ERBB3P21860 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ERBB3P21860 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms