Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SELPP16109 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SELPP16109 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SELPP16109 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SELPP16109 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SELPP16109 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SELPP16109 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SELPP16109 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SELPP16109 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SELPP16109 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SELPP16109 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SELPP16109 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SELPP16109 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SELPP16109 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SELPP16109 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SELPP16109 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SELPP16109 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SELPP16109 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SELPP16109 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SELPP16109 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SELPP16109 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SELPP16109 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SELPP16109 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SELPP16109 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SELPP16109 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SELPP16109 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SELPP16109 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SELPP16109 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SELPP16109 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SELPP16109 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SELPP16109 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SELPP16109 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SELPP16109 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SELPP16109 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SELPP16109 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SELPP16109 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SELPP16109 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SELPP16109 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SELPP16109 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SELPP16109 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SELPP16109 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SELPP16109 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SELPP16109 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SELPP16109 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SELPP16109 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SELPP16109 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SELPP16109 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SELPP16109 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SELPP16109 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SELPP16109 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SELPP16109 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SELPP16109 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SELPP16109 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SELPP16109 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SELPP16109 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SELPP16109 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SELPP16109 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SELPP16109 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SELPP16109 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SELPP16109 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SELPP16109 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SELPP16109 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SELPP16109 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SELPP16109 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SELPP16109 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SELPP16109 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SELPP16109 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SELPP16109 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SELPP16109 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SELPP16109 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SELPP16109 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SELPP16109 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SELPP16109 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SELPP16109 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SELPP16109 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SELPP16109 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SELPP16109 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SELPP16109 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SELPP16109 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SELPP16109 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SELPP16109 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SELPP16109 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SELPP16109 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SELPP16109 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SELPP16109 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SELPP16109 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SELPP16109 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SELPP16109 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SELPP16109 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SELPP16109 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SELPP16109 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SELPP16109 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SELPP16109 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SELPP16109 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SELPP16109 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SELPP16109 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SELPP16109 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SELPP16109 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SELPP16109 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SELPP16109 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms