Protein–RNA interactions for Protein: P0DP07

IGHV4-31, Immunoglobulin heavy variable 4-31, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV4-31P0DP07 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IGHV4-31P0DP07 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHV4-31P0DP07 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHV4-31P0DP07 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGHV4-31P0DP07 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IGHV4-31P0DP07 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IGHV4-31P0DP07 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHV4-31P0DP07 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHV4-31P0DP07 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHV4-31P0DP07 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGHV4-31P0DP07 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGHV4-31P0DP07 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGHV4-31P0DP07 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGHV4-31P0DP07 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHV4-31P0DP07 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGHV4-31P0DP07 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGHV4-31P0DP07 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGHV4-31P0DP07 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGHV4-31P0DP07 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHV4-31P0DP07 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGHV4-31P0DP07 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGHV4-31P0DP07 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGHV4-31P0DP07 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGHV4-31P0DP07 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGHV4-31P0DP07 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGHV4-31P0DP07 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGHV4-31P0DP07 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IGHV4-31P0DP07 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGHV4-31P0DP07 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGHV4-31P0DP07 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHV4-31P0DP07 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHV4-31P0DP07 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGHV4-31P0DP07 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHV4-31P0DP07 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHV4-31P0DP07 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHV4-31P0DP07 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGHV4-31P0DP07 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGHV4-31P0DP07 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGHV4-31P0DP07 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGHV4-31P0DP07 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV4-31P0DP07 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGHV4-31P0DP07 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGHV4-31P0DP07 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGHV4-31P0DP07 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGHV4-31P0DP07 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGHV4-31P0DP07 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGHV4-31P0DP07 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IGHV4-31P0DP07 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IGHV4-31P0DP07 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IGHV4-31P0DP07 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHV4-31P0DP07 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGHV4-31P0DP07 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHV4-31P0DP07 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHV4-31P0DP07 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHV4-31P0DP07 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHV4-31P0DP07 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHV4-31P0DP07 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHV4-31P0DP07 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHV4-31P0DP07 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGHV4-31P0DP07 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHV4-31P0DP07 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHV4-31P0DP07 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHV4-31P0DP07 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHV4-31P0DP07 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHV4-31P0DP07 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGHV4-31P0DP07 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHV4-31P0DP07 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHV4-31P0DP07 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHV4-31P0DP07 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHV4-31P0DP07 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHV4-31P0DP07 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHV4-31P0DP07 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHV4-31P0DP07 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHV4-31P0DP07 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGHV4-31P0DP07 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHV4-31P0DP07 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHV4-31P0DP07 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHV4-31P0DP07 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHV4-31P0DP07 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHV4-31P0DP07 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGHV4-31P0DP07 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGHV4-31P0DP07 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHV4-31P0DP07 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHV4-31P0DP07 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHV4-31P0DP07 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHV4-31P0DP07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHV4-31P0DP07 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHV4-31P0DP07 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHV4-31P0DP07 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHV4-31P0DP07 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHV4-31P0DP07 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHV4-31P0DP07 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHV4-31P0DP07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms