Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-30-5P0DP03 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-30-5P0DP03 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-30-5P0DP03 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-30-5P0DP03 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-30-5P0DP03 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-30-5P0DP03 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-30-5P0DP03 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-30-5P0DP03 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV3-30-5P0DP03 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-30-5P0DP03 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-30-5P0DP03 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-30-5P0DP03 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-30-5P0DP03 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-30-5P0DP03 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-30-5P0DP03 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-30-5P0DP03 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-30-5P0DP03 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-30-5P0DP03 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-30-5P0DP03 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-30-5P0DP03 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-30-5P0DP03 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-30-5P0DP03 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV3-30-5P0DP03 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV3-30-5P0DP03 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGHV3-30-5P0DP03 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-30-5P0DP03 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-30-5P0DP03 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-30-5P0DP03 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-30-5P0DP03 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-30-5P0DP03 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-30-5P0DP03 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-30-5P0DP03 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV3-30-5P0DP03 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV3-30-5P0DP03 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV3-30-5P0DP03 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV3-30-5P0DP03 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-30-5P0DP03 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-30-5P0DP03 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-30-5P0DP03 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHV3-30-5P0DP03 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHV3-30-5P0DP03 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHV3-30-5P0DP03 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHV3-30-5P0DP03 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHV3-30-5P0DP03 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-30-5P0DP03 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-30-5P0DP03 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGHV3-30-5P0DP03 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGHV3-30-5P0DP03 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGHV3-30-5P0DP03 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGHV3-30-5P0DP03 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGHV3-30-5P0DP03 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGHV3-30-5P0DP03 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IGHV3-30-5P0DP03 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IGHV3-30-5P0DP03 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IGHV3-30-5P0DP03 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IGHV3-30-5P0DP03 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IGHV3-30-5P0DP03 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IGHV3-30-5P0DP03 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGHV3-30-5P0DP03 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGHV3-30-5P0DP03 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGHV3-30-5P0DP03 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGHV3-30-5P0DP03 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGHV3-30-5P0DP03 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGHV3-30-5P0DP03 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGHV3-30-5P0DP03 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-30-5P0DP03 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGHV3-30-5P0DP03 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGHV3-30-5P0DP03 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGHV3-30-5P0DP03 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGHV3-30-5P0DP03 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGHV3-30-5P0DP03 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGHV3-30-5P0DP03 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGHV3-30-5P0DP03 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV3-30-5P0DP03 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGHV3-30-5P0DP03 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGHV3-30-5P0DP03 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGHV3-30-5P0DP03 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGHV3-30-5P0DP03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGHV3-30-5P0DP03 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGHV3-30-5P0DP03 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGHV3-30-5P0DP03 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGHV3-30-5P0DP03 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGHV3-30-5P0DP03 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms