Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PGA4P0DJD7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PGA4P0DJD7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
PGA4P0DJD7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PGA4P0DJD7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PGA4P0DJD7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PGA4P0DJD7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGA4P0DJD7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PGA4P0DJD7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PGA4P0DJD7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGA4P0DJD7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGA4P0DJD7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGA4P0DJD7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PGA4P0DJD7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PGA4P0DJD7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGA4P0DJD7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGA4P0DJD7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGA4P0DJD7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGA4P0DJD7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGA4P0DJD7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGA4P0DJD7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGA4P0DJD7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGA4P0DJD7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGA4P0DJD7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGA4P0DJD7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGA4P0DJD7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGA4P0DJD7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGA4P0DJD7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PGA4P0DJD7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGA4P0DJD7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGA4P0DJD7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGA4P0DJD7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGA4P0DJD7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PGA4P0DJD7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGA4P0DJD7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGA4P0DJD7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGA4P0DJD7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGA4P0DJD7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGA4P0DJD7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGA4P0DJD7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGA4P0DJD7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGA4P0DJD7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGA4P0DJD7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGA4P0DJD7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGA4P0DJD7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGA4P0DJD7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGA4P0DJD7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGA4P0DJD7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGA4P0DJD7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGA4P0DJD7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGA4P0DJD7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGA4P0DJD7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGA4P0DJD7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGA4P0DJD7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGA4P0DJD7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGA4P0DJD7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGA4P0DJD7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGA4P0DJD7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGA4P0DJD7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGA4P0DJD7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGA4P0DJD7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGA4P0DJD7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGA4P0DJD7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGA4P0DJD7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGA4P0DJD7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGA4P0DJD7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PGA4P0DJD7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGA4P0DJD7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGA4P0DJD7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGA4P0DJD7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGA4P0DJD7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGA4P0DJD7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGA4P0DJD7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGA4P0DJD7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGA4P0DJD7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGA4P0DJD7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGA4P0DJD7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGA4P0DJD7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGA4P0DJD7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGA4P0DJD7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGA4P0DJD7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGA4P0DJD7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGA4P0DJD7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGA4P0DJD7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGA4P0DJD7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PGA4P0DJD7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGA4P0DJD7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGA4P0DJD7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGA4P0DJD7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGA4P0DJD7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGA4P0DJD7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGA4P0DJD7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGA4P0DJD7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGA4P0DJD7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGA4P0DJD7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PGA4P0DJD7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGA4P0DJD7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGA4P0DJD7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGA4P0DJD7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGA4P0DJD7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms