Protein–RNA interactions for Protein: P07947

YES1, Tyrosine-protein kinase Yes, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YES1P07947 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
YES1P07947 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
YES1P07947 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
YES1P07947 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
YES1P07947 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
YES1P07947 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
YES1P07947 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
YES1P07947 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
YES1P07947 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
YES1P07947 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YES1P07947 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YES1P07947 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YES1P07947 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YES1P07947 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YES1P07947 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YES1P07947 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YES1P07947 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YES1P07947 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YES1P07947 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YES1P07947 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YES1P07947 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YES1P07947 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YES1P07947 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YES1P07947 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YES1P07947 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YES1P07947 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YES1P07947 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
YES1P07947 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YES1P07947 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YES1P07947 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YES1P07947 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YES1P07947 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YES1P07947 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YES1P07947 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YES1P07947 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YES1P07947 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YES1P07947 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YES1P07947 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YES1P07947 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YES1P07947 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YES1P07947 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YES1P07947 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YES1P07947 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YES1P07947 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
YES1P07947 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
YES1P07947 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
YES1P07947 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
YES1P07947 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YES1P07947 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YES1P07947 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YES1P07947 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YES1P07947 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YES1P07947 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YES1P07947 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YES1P07947 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YES1P07947 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YES1P07947 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
YES1P07947 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YES1P07947 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YES1P07947 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
YES1P07947 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YES1P07947 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YES1P07947 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YES1P07947 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YES1P07947 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YES1P07947 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YES1P07947 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YES1P07947 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YES1P07947 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YES1P07947 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YES1P07947 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YES1P07947 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YES1P07947 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YES1P07947 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
YES1P07947 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
YES1P07947 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YES1P07947 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
YES1P07947 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
YES1P07947 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
YES1P07947 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
YES1P07947 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YES1P07947 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YES1P07947 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YES1P07947 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YES1P07947 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YES1P07947 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
YES1P07947 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YES1P07947 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YES1P07947 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YES1P07947 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YES1P07947 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YES1P07947 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YES1P07947 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YES1P07947 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YES1P07947 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YES1P07947 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YES1P07947 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YES1P07947 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YES1P07947 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YES1P07947 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms