Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IFNA6P05013 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNA6P05013 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNA6P05013 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFNA6P05013 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNA6P05013 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNA6P05013 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFNA6P05013 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNA6P05013 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFNA6P05013 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNA6P05013 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNA6P05013 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNA6P05013 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNA6P05013 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNA6P05013 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNA6P05013 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNA6P05013 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNA6P05013 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFNA6P05013 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFNA6P05013 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFNA6P05013 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFNA6P05013 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFNA6P05013 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNA6P05013 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNA6P05013 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNA6P05013 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNA6P05013 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNA6P05013 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNA6P05013 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNA6P05013 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNA6P05013 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNA6P05013 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNA6P05013 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNA6P05013 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNA6P05013 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNA6P05013 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFNA6P05013 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNA6P05013 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFNA6P05013 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNA6P05013 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNA6P05013 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNA6P05013 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNA6P05013 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNA6P05013 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNA6P05013 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNA6P05013 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNA6P05013 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNA6P05013 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNA6P05013 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNA6P05013 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNA6P05013 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNA6P05013 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNA6P05013 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNA6P05013 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNA6P05013 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNA6P05013 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNA6P05013 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNA6P05013 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNA6P05013 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNA6P05013 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNA6P05013 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNA6P05013 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNA6P05013 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNA6P05013 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNA6P05013 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNA6P05013 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNA6P05013 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNA6P05013 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA6P05013 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNA6P05013 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNA6P05013 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNA6P05013 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNA6P05013 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNA6P05013 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNA6P05013 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNA6P05013 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNA6P05013 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNA6P05013 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNA6P05013 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNA6P05013 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNA6P05013 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNA6P05013 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNA6P05013 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNA6P05013 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNA6P05013 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNA6P05013 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNA6P05013 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNA6P05013 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNA6P05013 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNA6P05013 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA6P05013 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNA6P05013 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms