Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HLA-DPB1P04440 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HLA-DPB1P04440 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HLA-DPB1P04440 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HLA-DPB1P04440 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HLA-DPB1P04440 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HLA-DPB1P04440 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HLA-DPB1P04440 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HLA-DPB1P04440 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLA-DPB1P04440 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLA-DPB1P04440 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HLA-DPB1P04440 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HLA-DPB1P04440 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HLA-DPB1P04440 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HLA-DPB1P04440 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HLA-DPB1P04440 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLA-DPB1P04440 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HLA-DPB1P04440 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HLA-DPB1P04440 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLA-DPB1P04440 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HLA-DPB1P04440 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DPB1P04440 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HLA-DPB1P04440 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DPB1P04440 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DPB1P04440 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DPB1P04440 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DPB1P04440 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-DPB1P04440 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DPB1P04440 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DPB1P04440 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-DPB1P04440 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-DPB1P04440 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-DPB1P04440 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-DPB1P04440 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DPB1P04440 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DPB1P04440 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DPB1P04440 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DPB1P04440 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HLA-DPB1P04440 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DPB1P04440 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-DPB1P04440 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-DPB1P04440 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DPB1P04440 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HLA-DPB1P04440 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DPB1P04440 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-DPB1P04440 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-DPB1P04440 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DPB1P04440 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DPB1P04440 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DPB1P04440 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DPB1P04440 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DPB1P04440 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DPB1P04440 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-DPB1P04440 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-DPB1P04440 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-DPB1P04440 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-DPB1P04440 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HLA-DPB1P04440 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DPB1P04440 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DPB1P04440 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DPB1P04440 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-DPB1P04440 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-DPB1P04440 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-DPB1P04440 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-DPB1P04440 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-DPB1P04440 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-DPB1P04440 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HLA-DPB1P04440 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HLA-DPB1P04440 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-DPB1P04440 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-DPB1P04440 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DPB1P04440 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DPB1P04440 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DPB1P04440 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DPB1P04440 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DPB1P04440 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DPB1P04440 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DPB1P04440 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DPB1P04440 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DPB1P04440 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPB1P04440 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPB1P04440 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HLA-DPB1P04440 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DPB1P04440 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DPB1P04440 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DPB1P04440 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPB1P04440 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DPB1P04440 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DPB1P04440 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DPB1P04440 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DPB1P04440 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms