Protein–RNA interactions for Protein: P03979

TRGV3, T cell receptor gamma variable 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV3P03979 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRGV3P03979 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRGV3P03979 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRGV3P03979 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRGV3P03979 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRGV3P03979 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRGV3P03979 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRGV3P03979 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRGV3P03979 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRGV3P03979 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRGV3P03979 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRGV3P03979 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRGV3P03979 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRGV3P03979 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRGV3P03979 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRGV3P03979 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRGV3P03979 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRGV3P03979 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRGV3P03979 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRGV3P03979 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRGV3P03979 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRGV3P03979 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRGV3P03979 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRGV3P03979 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRGV3P03979 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRGV3P03979 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRGV3P03979 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRGV3P03979 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRGV3P03979 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRGV3P03979 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRGV3P03979 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRGV3P03979 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRGV3P03979 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRGV3P03979 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRGV3P03979 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRGV3P03979 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRGV3P03979 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRGV3P03979 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRGV3P03979 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRGV3P03979 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRGV3P03979 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRGV3P03979 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRGV3P03979 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRGV3P03979 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRGV3P03979 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRGV3P03979 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRGV3P03979 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRGV3P03979 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRGV3P03979 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRGV3P03979 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRGV3P03979 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRGV3P03979 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRGV3P03979 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRGV3P03979 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRGV3P03979 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRGV3P03979 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRGV3P03979 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRGV3P03979 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRGV3P03979 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRGV3P03979 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRGV3P03979 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRGV3P03979 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRGV3P03979 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRGV3P03979 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRGV3P03979 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRGV3P03979 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRGV3P03979 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRGV3P03979 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRGV3P03979 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRGV3P03979 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRGV3P03979 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRGV3P03979 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRGV3P03979 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRGV3P03979 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRGV3P03979 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRGV3P03979 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRGV3P03979 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRGV3P03979 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRGV3P03979 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRGV3P03979 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRGV3P03979 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRGV3P03979 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRGV3P03979 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRGV3P03979 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRGV3P03979 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRGV3P03979 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRGV3P03979 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRGV3P03979 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRGV3P03979 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRGV3P03979 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRGV3P03979 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRGV3P03979 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRGV3P03979 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms