Protein–RNA interactions for Protein: P01909

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1P01909 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DQA1P01909 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DQA1P01909 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DQA1P01909 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DQA1P01909 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQA1P01909 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA1P01909 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQA1P01909 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DQA1P01909 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA1P01909 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DQA1P01909 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQA1P01909 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DQA1P01909 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQA1P01909 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQA1P01909 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQA1P01909 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQA1P01909 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQA1P01909 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQA1P01909 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQA1P01909 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DQA1P01909 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQA1P01909 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQA1P01909 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DQA1P01909 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQA1P01909 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQA1P01909 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DQA1P01909 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA1P01909 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DQA1P01909 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DQA1P01909 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DQA1P01909 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA1P01909 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA1P01909 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA1P01909 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA1P01909 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA1P01909 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA1P01909 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA1P01909 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1P01909 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1P01909 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA1P01909 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA1P01909 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1P01909 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1P01909 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DQA1P01909 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DQA1P01909 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DQA1P01909 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DQA1P01909 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DQA1P01909 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DQA1P01909 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DQA1P01909 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1P01909 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1P01909 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1P01909 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1P01909 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1P01909 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQA1P01909 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQA1P01909 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DQA1P01909 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DQA1P01909 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DQA1P01909 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DQA1P01909 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DQA1P01909 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DQA1P01909 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQA1P01909 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQA1P01909 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1P01909 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQA1P01909 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQA1P01909 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQA1P01909 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1P01909 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQA1P01909 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1P01909 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA1P01909 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1P01909 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1P01909 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1P01909 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1P01909 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQA1P01909 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1P01909 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1P01909 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1P01909 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQA1P01909 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-DQA1P01909 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DQA1P01909 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms