Protein–RNA interactions for Protein: P01583

IL1A, Interleukin-1 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1AP01583 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IL1AP01583 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IL1AP01583 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IL1AP01583 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IL1AP01583 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IL1AP01583 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IL1AP01583 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IL1AP01583 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IL1AP01583 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IL1AP01583 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IL1AP01583 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IL1AP01583 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IL1AP01583 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IL1AP01583 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IL1AP01583 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IL1AP01583 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IL1AP01583 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IL1AP01583 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IL1AP01583 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IL1AP01583 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IL1AP01583 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IL1AP01583 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IL1AP01583 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IL1AP01583 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IL1AP01583 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IL1AP01583 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IL1AP01583 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IL1AP01583 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IL1AP01583 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1AP01583 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IL1AP01583 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL1AP01583 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IL1AP01583 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IL1AP01583 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IL1AP01583 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IL1AP01583 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IL1AP01583 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IL1AP01583 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IL1AP01583 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IL1AP01583 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IL1AP01583 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IL1AP01583 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IL1AP01583 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IL1AP01583 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IL1AP01583 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IL1AP01583 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IL1AP01583 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IL1AP01583 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IL1AP01583 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IL1AP01583 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IL1AP01583 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IL1AP01583 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IL1AP01583 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IL1AP01583 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IL1AP01583 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IL1AP01583 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IL1AP01583 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IL1AP01583 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IL1AP01583 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IL1AP01583 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IL1AP01583 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IL1AP01583 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IL1AP01583 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IL1AP01583 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IL1AP01583 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IL1AP01583 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IL1AP01583 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IL1AP01583 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IL1AP01583 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IL1AP01583 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IL1AP01583 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IL1AP01583 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IL1AP01583 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IL1AP01583 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IL1AP01583 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IL1AP01583 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IL1AP01583 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IL1AP01583 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IL1AP01583 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IL1AP01583 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IL1AP01583 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IL1AP01583 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IL1AP01583 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IL1AP01583 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IL1AP01583 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IL1AP01583 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IL1AP01583 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IL1AP01583 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IL1AP01583 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IL1AP01583 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IL1AP01583 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IL1AP01583 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IL1AP01583 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IL1AP01583 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IL1AP01583 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IL1AP01583 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IL1AP01583 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IL1AP01583 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IL1AP01583 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IL1AP01583 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms