Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNAP29O95721 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNAP29O95721 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNAP29O95721 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP29O95721 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SNAP29O95721 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNAP29O95721 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNAP29O95721 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNAP29O95721 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNAP29O95721 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAP29O95721 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAP29O95721 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAP29O95721 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAP29O95721 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP29O95721 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP29O95721 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP29O95721 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAP29O95721 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP29O95721 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNAP29O95721 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNAP29O95721 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP29O95721 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP29O95721 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNAP29O95721 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP29O95721 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAP29O95721 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAP29O95721 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP29O95721 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAP29O95721 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAP29O95721 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAP29O95721 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP29O95721 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP29O95721 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP29O95721 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNAP29O95721 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP29O95721 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP29O95721 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP29O95721 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP29O95721 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP29O95721 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP29O95721 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP29O95721 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP29O95721 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP29O95721 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP29O95721 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP29O95721 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP29O95721 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP29O95721 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP29O95721 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP29O95721 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP29O95721 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP29O95721 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAP29O95721 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAP29O95721 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAP29O95721 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAP29O95721 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAP29O95721 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP29O95721 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAP29O95721 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAP29O95721 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNAP29O95721 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP29O95721 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP29O95721 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP29O95721 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNAP29O95721 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP29O95721 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNAP29O95721 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP29O95721 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP29O95721 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP29O95721 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP29O95721 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP29O95721 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP29O95721 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP29O95721 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP29O95721 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP29O95721 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP29O95721 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP29O95721 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP29O95721 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP29O95721 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP29O95721 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP29O95721 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP29O95721 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNAP29O95721 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNAP29O95721 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms