Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PAPLNO95428 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PAPLNO95428 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PAPLNO95428 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PAPLNO95428 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PAPLNO95428 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PAPLNO95428 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PAPLNO95428 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PAPLNO95428 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PAPLNO95428 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PAPLNO95428 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PAPLNO95428 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PAPLNO95428 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PAPLNO95428 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PAPLNO95428 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PAPLNO95428 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PAPLNO95428 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PAPLNO95428 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PAPLNO95428 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PAPLNO95428 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PAPLNO95428 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PAPLNO95428 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PAPLNO95428 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PAPLNO95428 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PAPLNO95428 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PAPLNO95428 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPLNO95428 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PAPLNO95428 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAPLNO95428 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PAPLNO95428 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PAPLNO95428 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PAPLNO95428 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PAPLNO95428 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PAPLNO95428 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PAPLNO95428 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PAPLNO95428 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PAPLNO95428 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PAPLNO95428 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PAPLNO95428 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PAPLNO95428 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PAPLNO95428 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PAPLNO95428 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPLNO95428 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPLNO95428 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPLNO95428 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PAPLNO95428 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PAPLNO95428 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PAPLNO95428 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PAPLNO95428 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PAPLNO95428 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PAPLNO95428 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PAPLNO95428 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PAPLNO95428 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PAPLNO95428 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PAPLNO95428 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PAPLNO95428 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PAPLNO95428 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PAPLNO95428 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PAPLNO95428 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PAPLNO95428 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PAPLNO95428 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PAPLNO95428 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPLNO95428 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PAPLNO95428 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PAPLNO95428 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PAPLNO95428 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PAPLNO95428 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PAPLNO95428 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PAPLNO95428 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PAPLNO95428 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PAPLNO95428 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PAPLNO95428 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAPLNO95428 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PAPLNO95428 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PAPLNO95428 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PAPLNO95428 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PAPLNO95428 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PAPLNO95428 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PAPLNO95428 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PAPLNO95428 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PAPLNO95428 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PAPLNO95428 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PAPLNO95428 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PAPLNO95428 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PAPLNO95428 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PAPLNO95428 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PAPLNO95428 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PAPLNO95428 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PAPLNO95428 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PAPLNO95428 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PAPLNO95428 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PAPLNO95428 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PAPLNO95428 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms