Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SOX30O94993 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOX30O94993 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SOX30O94993 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SOX30O94993 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SOX30O94993 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOX30O94993 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SOX30O94993 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOX30O94993 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOX30O94993 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOX30O94993 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOX30O94993 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SOX30O94993 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOX30O94993 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOX30O94993 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOX30O94993 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOX30O94993 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOX30O94993 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOX30O94993 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX30O94993 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SOX30O94993 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOX30O94993 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SOX30O94993 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX30O94993 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX30O94993 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX30O94993 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SOX30O94993 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX30O94993 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX30O94993 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX30O94993 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX30O94993 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX30O94993 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOX30O94993 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOX30O94993 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOX30O94993 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX30O94993 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SOX30O94993 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX30O94993 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX30O94993 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX30O94993 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX30O94993 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX30O94993 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX30O94993 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOX30O94993 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX30O94993 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX30O94993 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX30O94993 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX30O94993 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX30O94993 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX30O94993 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX30O94993 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX30O94993 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX30O94993 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX30O94993 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX30O94993 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX30O94993 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX30O94993 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX30O94993 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX30O94993 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX30O94993 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX30O94993 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX30O94993 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOX30O94993 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SOX30O94993 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SOX30O94993 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX30O94993 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SOX30O94993 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX30O94993 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX30O94993 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX30O94993 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX30O94993 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX30O94993 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX30O94993 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX30O94993 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX30O94993 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX30O94993 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX30O94993 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX30O94993 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SOX30O94993 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX30O94993 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX30O94993 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX30O94993 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX30O94993 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX30O94993 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SOX30O94993 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX30O94993 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX30O94993 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX30O94993 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX30O94993 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX30O94993 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX30O94993 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX30O94993 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX30O94993 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX30O94993 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX30O94993 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX30O94993 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX30O94993 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX30O94993 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX30O94993 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX30O94993 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms