Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.01■■■■■ 4.48
BBOX1O75936 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
BBOX1O75936 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
BBOX1O75936 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
BBOX1O75936 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
BBOX1O75936 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BBOX1O75936 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
BBOX1O75936 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
BBOX1O75936 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
BBOX1O75936 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BBOX1O75936 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
BBOX1O75936 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
BBOX1O75936 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
BBOX1O75936 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
BBOX1O75936 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
BBOX1O75936 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
BBOX1O75936 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
BBOX1O75936 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
BBOX1O75936 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
BBOX1O75936 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BBOX1O75936 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BBOX1O75936 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
BBOX1O75936 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BBOX1O75936 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BBOX1O75936 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
BBOX1O75936 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BBOX1O75936 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
BBOX1O75936 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
BBOX1O75936 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
BBOX1O75936 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
BBOX1O75936 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BBOX1O75936 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
BBOX1O75936 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
BBOX1O75936 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
BBOX1O75936 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
BBOX1O75936 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
BBOX1O75936 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
BBOX1O75936 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
BBOX1O75936 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
BBOX1O75936 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BBOX1O75936 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
BBOX1O75936 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BBOX1O75936 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BBOX1O75936 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
BBOX1O75936 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BBOX1O75936 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
BBOX1O75936 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BBOX1O75936 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BBOX1O75936 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
BBOX1O75936 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BBOX1O75936 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
BBOX1O75936 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BBOX1O75936 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
BBOX1O75936 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BBOX1O75936 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
BBOX1O75936 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
BBOX1O75936 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BBOX1O75936 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BBOX1O75936 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BBOX1O75936 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
BBOX1O75936 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BBOX1O75936 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BBOX1O75936 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
BBOX1O75936 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
BBOX1O75936 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
BBOX1O75936 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BBOX1O75936 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
BBOX1O75936 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
BBOX1O75936 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
BBOX1O75936 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
BBOX1O75936 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BBOX1O75936 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
BBOX1O75936 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BBOX1O75936 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BBOX1O75936 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
BBOX1O75936 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
BBOX1O75936 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
BBOX1O75936 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
BBOX1O75936 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
BBOX1O75936 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
BBOX1O75936 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
BBOX1O75936 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BBOX1O75936 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
BBOX1O75936 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
BBOX1O75936 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
BBOX1O75936 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BBOX1O75936 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BBOX1O75936 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BBOX1O75936 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BBOX1O75936 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BBOX1O75936 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BBOX1O75936 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
BBOX1O75936 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BBOX1O75936 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
BBOX1O75936 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BBOX1O75936 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BBOX1O75936 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BBOX1O75936 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
BBOX1O75936 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
BBOX1O75936 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms