Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GABBR2O75899 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
GABBR2O75899 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
GABBR2O75899 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GABBR2O75899 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GABBR2O75899 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GABBR2O75899 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GABBR2O75899 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GABBR2O75899 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GABBR2O75899 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GABBR2O75899 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GABBR2O75899 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GABBR2O75899 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GABBR2O75899 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GABBR2O75899 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GABBR2O75899 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GABBR2O75899 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GABBR2O75899 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GABBR2O75899 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GABBR2O75899 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GABBR2O75899 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GABBR2O75899 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GABBR2O75899 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GABBR2O75899 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GABBR2O75899 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GABBR2O75899 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GABBR2O75899 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GABBR2O75899 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GABBR2O75899 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GABBR2O75899 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GABBR2O75899 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GABBR2O75899 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GABBR2O75899 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GABBR2O75899 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GABBR2O75899 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GABBR2O75899 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GABBR2O75899 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GABBR2O75899 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GABBR2O75899 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GABBR2O75899 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GABBR2O75899 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GABBR2O75899 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GABBR2O75899 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GABBR2O75899 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GABBR2O75899 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GABBR2O75899 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GABBR2O75899 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GABBR2O75899 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GABBR2O75899 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GABBR2O75899 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GABBR2O75899 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
GABBR2O75899 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GABBR2O75899 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GABBR2O75899 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GABBR2O75899 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GABBR2O75899 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GABBR2O75899 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GABBR2O75899 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GABBR2O75899 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
GABBR2O75899 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GABBR2O75899 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GABBR2O75899 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GABBR2O75899 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GABBR2O75899 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GABBR2O75899 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GABBR2O75899 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GABBR2O75899 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GABBR2O75899 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GABBR2O75899 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GABBR2O75899 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GABBR2O75899 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GABBR2O75899 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GABBR2O75899 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GABBR2O75899 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GABBR2O75899 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GABBR2O75899 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GABBR2O75899 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GABBR2O75899 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GABBR2O75899 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GABBR2O75899 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GABBR2O75899 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GABBR2O75899 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GABBR2O75899 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GABBR2O75899 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GABBR2O75899 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GABBR2O75899 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GABBR2O75899 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GABBR2O75899 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GABBR2O75899 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GABBR2O75899 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GABBR2O75899 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GABBR2O75899 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GABBR2O75899 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GABBR2O75899 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GABBR2O75899 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GABBR2O75899 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GABBR2O75899 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GABBR2O75899 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GABBR2O75899 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GABBR2O75899 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms