Protein–RNA interactions for Protein: O75844

ZMPSTE24, CAAX prenyl protease 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMPSTE24O75844 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZMPSTE24O75844 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZMPSTE24O75844 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZMPSTE24O75844 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ZMPSTE24O75844 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZMPSTE24O75844 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZMPSTE24O75844 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ZMPSTE24O75844 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZMPSTE24O75844 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZMPSTE24O75844 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZMPSTE24O75844 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZMPSTE24O75844 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZMPSTE24O75844 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZMPSTE24O75844 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZMPSTE24O75844 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZMPSTE24O75844 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZMPSTE24O75844 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZMPSTE24O75844 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZMPSTE24O75844 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZMPSTE24O75844 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZMPSTE24O75844 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZMPSTE24O75844 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZMPSTE24O75844 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZMPSTE24O75844 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZMPSTE24O75844 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ZMPSTE24O75844 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZMPSTE24O75844 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZMPSTE24O75844 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZMPSTE24O75844 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ZMPSTE24O75844 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZMPSTE24O75844 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZMPSTE24O75844 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZMPSTE24O75844 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZMPSTE24O75844 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZMPSTE24O75844 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZMPSTE24O75844 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZMPSTE24O75844 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZMPSTE24O75844 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZMPSTE24O75844 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZMPSTE24O75844 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZMPSTE24O75844 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZMPSTE24O75844 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZMPSTE24O75844 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZMPSTE24O75844 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZMPSTE24O75844 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZMPSTE24O75844 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZMPSTE24O75844 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZMPSTE24O75844 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZMPSTE24O75844 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZMPSTE24O75844 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZMPSTE24O75844 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ZMPSTE24O75844 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZMPSTE24O75844 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZMPSTE24O75844 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZMPSTE24O75844 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZMPSTE24O75844 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZMPSTE24O75844 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZMPSTE24O75844 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZMPSTE24O75844 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZMPSTE24O75844 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZMPSTE24O75844 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZMPSTE24O75844 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZMPSTE24O75844 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZMPSTE24O75844 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZMPSTE24O75844 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ZMPSTE24O75844 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZMPSTE24O75844 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZMPSTE24O75844 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ZMPSTE24O75844 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZMPSTE24O75844 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZMPSTE24O75844 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZMPSTE24O75844 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZMPSTE24O75844 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZMPSTE24O75844 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZMPSTE24O75844 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZMPSTE24O75844 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZMPSTE24O75844 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZMPSTE24O75844 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZMPSTE24O75844 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZMPSTE24O75844 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMPSTE24O75844 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZMPSTE24O75844 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZMPSTE24O75844 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZMPSTE24O75844 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMPSTE24O75844 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZMPSTE24O75844 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZMPSTE24O75844 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZMPSTE24O75844 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZMPSTE24O75844 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZMPSTE24O75844 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZMPSTE24O75844 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZMPSTE24O75844 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMPSTE24O75844 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZMPSTE24O75844 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZMPSTE24O75844 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZMPSTE24O75844 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZMPSTE24O75844 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMPSTE24O75844 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZMPSTE24O75844 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZMPSTE24O75844 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms